Protein–RNA interactions for Protein: P15498

VAV1, Proto-oncogene vav, humanhuman

Predictions only

Length 845 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAV1P15498 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VAV1P15498 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VAV1P15498 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VAV1P15498 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VAV1P15498 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VAV1P15498 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VAV1P15498 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VAV1P15498 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VAV1P15498 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VAV1P15498 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VAV1P15498 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VAV1P15498 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VAV1P15498 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VAV1P15498 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
VAV1P15498 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VAV1P15498 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VAV1P15498 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VAV1P15498 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VAV1P15498 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VAV1P15498 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VAV1P15498 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VAV1P15498 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VAV1P15498 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VAV1P15498 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VAV1P15498 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VAV1P15498 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VAV1P15498 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VAV1P15498 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VAV1P15498 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VAV1P15498 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VAV1P15498 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VAV1P15498 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
VAV1P15498 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VAV1P15498 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VAV1P15498 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VAV1P15498 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
VAV1P15498 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VAV1P15498 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
VAV1P15498 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VAV1P15498 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VAV1P15498 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
VAV1P15498 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VAV1P15498 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
VAV1P15498 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VAV1P15498 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
VAV1P15498 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
VAV1P15498 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
VAV1P15498 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VAV1P15498 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
VAV1P15498 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VAV1P15498 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VAV1P15498 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VAV1P15498 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VAV1P15498 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
VAV1P15498 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
VAV1P15498 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
VAV1P15498 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
VAV1P15498 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
VAV1P15498 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
VAV1P15498 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VAV1P15498 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VAV1P15498 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VAV1P15498 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VAV1P15498 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
VAV1P15498 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VAV1P15498 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VAV1P15498 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
VAV1P15498 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
VAV1P15498 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
VAV1P15498 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
VAV1P15498 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VAV1P15498 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VAV1P15498 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VAV1P15498 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
VAV1P15498 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
VAV1P15498 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VAV1P15498 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
VAV1P15498 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VAV1P15498 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VAV1P15498 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VAV1P15498 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VAV1P15498 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VAV1P15498 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VAV1P15498 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VAV1P15498 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VAV1P15498 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VAV1P15498 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VAV1P15498 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
VAV1P15498 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VAV1P15498 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VAV1P15498 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VAV1P15498 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VAV1P15498 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
VAV1P15498 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
VAV1P15498 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VAV1P15498 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VAV1P15498 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VAV1P15498 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
VAV1P15498 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
VAV1P15498 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57 ms