Protein–RNA interactions for Protein: P0DMW5

SMIM10L2B, Small integral membrane protein 10-like protein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM10L2BP0DMW5 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SMIM10L2BP0DMW5 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMIM10L2BP0DMW5 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMIM10L2BP0DMW5 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMIM10L2BP0DMW5 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMIM10L2BP0DMW5 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMIM10L2BP0DMW5 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMIM10L2BP0DMW5 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SMIM10L2BP0DMW5 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMIM10L2BP0DMW5 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMIM10L2BP0DMW5 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMIM10L2BP0DMW5 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMIM10L2BP0DMW5 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMIM10L2BP0DMW5 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMIM10L2BP0DMW5 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMIM10L2BP0DMW5 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMIM10L2BP0DMW5 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMIM10L2BP0DMW5 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMIM10L2BP0DMW5 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMIM10L2BP0DMW5 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SMIM10L2BP0DMW5 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMIM10L2BP0DMW5 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMIM10L2BP0DMW5 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMIM10L2BP0DMW5 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMIM10L2BP0DMW5 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMIM10L2BP0DMW5 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMIM10L2BP0DMW5 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMIM10L2BP0DMW5 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMIM10L2BP0DMW5 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SMIM10L2BP0DMW5 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMIM10L2BP0DMW5 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMIM10L2BP0DMW5 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMIM10L2BP0DMW5 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMIM10L2BP0DMW5 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMIM10L2BP0DMW5 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMIM10L2BP0DMW5 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMIM10L2BP0DMW5 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMIM10L2BP0DMW5 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMIM10L2BP0DMW5 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMIM10L2BP0DMW5 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMIM10L2BP0DMW5 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMIM10L2BP0DMW5 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMIM10L2BP0DMW5 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMIM10L2BP0DMW5 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMIM10L2BP0DMW5 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMIM10L2BP0DMW5 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMIM10L2BP0DMW5 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
SMIM10L2BP0DMW5 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SMIM10L2BP0DMW5 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SMIM10L2BP0DMW5 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SMIM10L2BP0DMW5 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SMIM10L2BP0DMW5 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SMIM10L2BP0DMW5 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SMIM10L2BP0DMW5 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SMIM10L2BP0DMW5 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SMIM10L2BP0DMW5 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SMIM10L2BP0DMW5 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SMIM10L2BP0DMW5 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SMIM10L2BP0DMW5 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SMIM10L2BP0DMW5 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SMIM10L2BP0DMW5 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SMIM10L2BP0DMW5 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SMIM10L2BP0DMW5 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SMIM10L2BP0DMW5 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SMIM10L2BP0DMW5 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SMIM10L2BP0DMW5 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SMIM10L2BP0DMW5 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SMIM10L2BP0DMW5 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SMIM10L2BP0DMW5 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SMIM10L2BP0DMW5 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SMIM10L2BP0DMW5 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SMIM10L2BP0DMW5 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SMIM10L2BP0DMW5 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SMIM10L2BP0DMW5 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SMIM10L2BP0DMW5 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SMIM10L2BP0DMW5 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SMIM10L2BP0DMW5 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SMIM10L2BP0DMW5 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SMIM10L2BP0DMW5 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SMIM10L2BP0DMW5 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SMIM10L2BP0DMW5 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SMIM10L2BP0DMW5 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SMIM10L2BP0DMW5 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SMIM10L2BP0DMW5 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SMIM10L2BP0DMW5 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SMIM10L2BP0DMW5 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SMIM10L2BP0DMW5 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SMIM10L2BP0DMW5 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SMIM10L2BP0DMW5 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SMIM10L2BP0DMW5 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SMIM10L2BP0DMW5 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SMIM10L2BP0DMW5 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SMIM10L2BP0DMW5 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SMIM10L2BP0DMW5 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SMIM10L2BP0DMW5 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SMIM10L2BP0DMW5 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SMIM10L2BP0DMW5 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SMIM10L2BP0DMW5 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SMIM10L2BP0DMW5 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SMIM10L2BP0DMW5 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms