Protein–RNA interactions for Protein: P0C0L5

C4B, Complement C4-B, humanhuman

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Length 1,744 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4BP0C0L5 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
C4BP0C0L5 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
C4BP0C0L5 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
C4BP0C0L5 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
C4BP0C0L5 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
C4BP0C0L5 RAB36-202ENST00000341989 936 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
C4BP0C0L5 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
C4BP0C0L5 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
C4BP0C0L5 Z97180.1-201ENST00000445173 988 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
C4BP0C0L5 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
C4BP0C0L5 SZRD1-203ENST00000471507 892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
C4BP0C0L5 CLDN11-207ENST00000486975 1139 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
C4BP0C0L5 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
C4BP0C0L5 TMEM205-216ENST00000593256 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
C4BP0C0L5 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
C4BP0C0L5 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
C4BP0C0L5 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
C4BP0C0L5 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
C4BP0C0L5 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
C4BP0C0L5 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
C4BP0C0L5 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
C4BP0C0L5 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
C4BP0C0L5 DNASE1L2-204ENST00000567494 1301 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
C4BP0C0L5 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
C4BP0C0L5 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
C4BP0C0L5 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
C4BP0C0L5 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
C4BP0C0L5 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
C4BP0C0L5 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
C4BP0C0L5 AL596276.2-201ENST00000447525 331 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
C4BP0C0L5 AC104784.1-201ENST00000473096 294 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
C4BP0C0L5 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
C4BP0C0L5 NEAT1-203ENST00000601801 487 ntTSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
C4BP0C0L5 DYRK1B-208ENST00000601972 772 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
C4BP0C0L5 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
C4BP0C0L5 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
C4BP0C0L5 DLG1-AS1-202ENST00000430666 1694 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
C4BP0C0L5 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
C4BP0C0L5 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
C4BP0C0L5 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
C4BP0C0L5 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
C4BP0C0L5 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
C4BP0C0L5 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
C4BP0C0L5 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
C4BP0C0L5 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
C4BP0C0L5 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
C4BP0C0L5 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
C4BP0C0L5 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
C4BP0C0L5 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
C4BP0C0L5 ANK1-203ENST00000314214 1185 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
C4BP0C0L5 ANKDD1A-203ENST00000395723 1250 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
C4BP0C0L5 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
C4BP0C0L5 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
C4BP0C0L5 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
C4BP0C0L5 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
C4BP0C0L5 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
C4BP0C0L5 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
C4BP0C0L5 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
C4BP0C0L5 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
C4BP0C0L5 AC104667.2-202ENST00000452801 1301 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
C4BP0C0L5 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
C4BP0C0L5 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
C4BP0C0L5 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
C4BP0C0L5 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
C4BP0C0L5 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
C4BP0C0L5 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
C4BP0C0L5 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
C4BP0C0L5 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
C4BP0C0L5 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
C4BP0C0L5 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
C4BP0C0L5 ARMC12-203ENST00000373869 1111 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
C4BP0C0L5 C6orf136-202ENST00000376471 614 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
C4BP0C0L5 PSMG4-203ENST00000380306 726 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
C4BP0C0L5 MYO16-AS1-201ENST00000439299 580 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
C4BP0C0L5 LINC01475-201ENST00000548010 766 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
C4BP0C0L5 CMTM3-215ENST00000568477 687 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
C4BP0C0L5 C19orf25-205ENST00000588427 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
C4BP0C0L5 SRD5A3-AS1-211ENST00000599135 737 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
C4BP0C0L5 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
C4BP0C0L5 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
C4BP0C0L5 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
C4BP0C0L5 SPERT-204ENST00000610924 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
C4BP0C0L5 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
C4BP0C0L5 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
C4BP0C0L5 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
C4BP0C0L5 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
C4BP0C0L5 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
C4BP0C0L5 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
C4BP0C0L5 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
C4BP0C0L5 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
C4BP0C0L5 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
C4BP0C0L5 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
C4BP0C0L5 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
C4BP0C0L5 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
C4BP0C0L5 AC012618.1-201ENST00000461223 412 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
C4BP0C0L5 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
C4BP0C0L5 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
C4BP0C0L5 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
C4BP0C0L5 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
C4BP0C0L5 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
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