Protein–RNA interactions for Protein: P08F94

PKHD1, Fibrocystin, humanhuman

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Length 4,074 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKHD1P08F94 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
PKHD1P08F94 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
PKHD1P08F94 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
PKHD1P08F94 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
PKHD1P08F94 XKRX-202ENST00000468904 2249 ntTSL 2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
PKHD1P08F94 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
PKHD1P08F94 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
PKHD1P08F94 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
PKHD1P08F94 TTPAL-203ENST00000372906 1139 ntTSL 3 BASIC9.81□□□□□ -0.84
PKHD1P08F94 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
PKHD1P08F94 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
PKHD1P08F94 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
PKHD1P08F94 AC098934.1-204ENST00000430114 631 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
PKHD1P08F94 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
PKHD1P08F94 SNCB-203ENST00000506696 552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
PKHD1P08F94 FTLP5-201ENST00000586853 534 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
PKHD1P08F94 SMIM22-209ENST00000591870 355 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
PKHD1P08F94 AP005264.3-201ENST00000592370 485 ntTSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
PKHD1P08F94 MBD3L2B-201ENST00000636986 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
PKHD1P08F94 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
PKHD1P08F94 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC9.81□□□□□ -0.84
PKHD1P08F94 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
PKHD1P08F94 IL9RP3-201ENST00000442856 1674 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
PKHD1P08F94 TMPRSS4-211ENST00000522307 1634 ntTSL 2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
PKHD1P08F94 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
PKHD1P08F94 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
PKHD1P08F94 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
PKHD1P08F94 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
PKHD1P08F94 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
PKHD1P08F94 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
PKHD1P08F94 MIR4435-2HG-204ENST00000419736 777 ntTSL 3 BASIC9.81□□□□□ -0.84
PKHD1P08F94 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
PKHD1P08F94 VEGFB-202ENST00000426086 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
PKHD1P08F94 AC245884.1-201ENST00000457113 529 ntTSL 3 BASIC9.81□□□□□ -0.84
PKHD1P08F94 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
PKHD1P08F94 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
PKHD1P08F94 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC9.81□□□□□ -0.84
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PKHD1P08F94 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
PKHD1P08F94 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
PKHD1P08F94 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
PKHD1P08F94 HPN-206ENST00000597419 1212 ntTSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
PKHD1P08F94 AC244250.3-201ENST00000620749 366 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
PKHD1P08F94 HTR4-213ENST00000631296 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
PKHD1P08F94 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
PKHD1P08F94 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
PKHD1P08F94 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
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PKHD1P08F94 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
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PKHD1P08F94 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
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PKHD1P08F94 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
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PKHD1P08F94 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
PKHD1P08F94 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
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PKHD1P08F94 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
PKHD1P08F94 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC9.8□□□□□ -0.84
PKHD1P08F94 INS-IGF2-202ENST00000397270 828 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
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PKHD1P08F94 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
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PKHD1P08F94 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
PKHD1P08F94 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
PKHD1P08F94 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
PKHD1P08F94 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
PKHD1P08F94 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
PKHD1P08F94 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
PKHD1P08F94 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
PKHD1P08F94 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
PKHD1P08F94 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
PKHD1P08F94 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
PKHD1P08F94 MAP2K3-201ENST00000316920 1246 ntTSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
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PKHD1P08F94 RNF216P1-212ENST00000493407 659 ntTSL 3 BASIC9.8□□□□□ -0.84
PKHD1P08F94 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC9.8□□□□□ -0.84
PKHD1P08F94 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
PKHD1P08F94 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
PKHD1P08F94 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
PKHD1P08F94 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
PKHD1P08F94 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
PKHD1P08F94 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
PKHD1P08F94 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
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