Protein–RNA interactions for Protein: P05090

APOD, Apolipoprotein D, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APODP05090 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
APODP05090 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
APODP05090 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
APODP05090 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
APODP05090 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
APODP05090 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
APODP05090 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
APODP05090 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
APODP05090 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
APODP05090 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
APODP05090 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
APODP05090 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
APODP05090 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
APODP05090 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
APODP05090 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
APODP05090 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
APODP05090 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
APODP05090 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
APODP05090 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
APODP05090 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
APODP05090 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
APODP05090 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
APODP05090 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
APODP05090 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
APODP05090 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
APODP05090 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
APODP05090 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
APODP05090 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
APODP05090 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
APODP05090 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
APODP05090 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.13
APODP05090 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
APODP05090 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
APODP05090 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
APODP05090 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
APODP05090 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
APODP05090 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
APODP05090 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
APODP05090 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
APODP05090 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
APODP05090 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
APODP05090 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
APODP05090 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
APODP05090 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
APODP05090 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
APODP05090 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
APODP05090 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
APODP05090 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
APODP05090 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
APODP05090 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
APODP05090 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
APODP05090 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
APODP05090 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
APODP05090 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
APODP05090 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
APODP05090 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
APODP05090 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
APODP05090 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
APODP05090 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
APODP05090 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
APODP05090 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
APODP05090 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
APODP05090 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
APODP05090 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
APODP05090 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
APODP05090 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
APODP05090 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
APODP05090 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
APODP05090 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
APODP05090 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
APODP05090 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
APODP05090 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
APODP05090 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
APODP05090 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
APODP05090 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
APODP05090 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
APODP05090 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
APODP05090 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
APODP05090 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
APODP05090 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
APODP05090 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
APODP05090 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
APODP05090 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
APODP05090 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
APODP05090 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
APODP05090 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
APODP05090 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
APODP05090 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
APODP05090 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
APODP05090 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
APODP05090 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
APODP05090 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
APODP05090 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
APODP05090 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
APODP05090 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
APODP05090 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
APODP05090 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
APODP05090 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
APODP05090 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
APODP05090 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.2 ms