Protein–RNA interactions for Protein: O43854

EDIL3, EGF-like repeat and discoidin I-like domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDIL3O43854 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
EDIL3O43854 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
EDIL3O43854 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
EDIL3O43854 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
EDIL3O43854 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
EDIL3O43854 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
EDIL3O43854 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
EDIL3O43854 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
EDIL3O43854 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
EDIL3O43854 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
EDIL3O43854 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
EDIL3O43854 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
EDIL3O43854 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
EDIL3O43854 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
EDIL3O43854 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
EDIL3O43854 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
EDIL3O43854 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
EDIL3O43854 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
EDIL3O43854 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
EDIL3O43854 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
EDIL3O43854 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
EDIL3O43854 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
EDIL3O43854 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
EDIL3O43854 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
EDIL3O43854 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
EDIL3O43854 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
EDIL3O43854 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
EDIL3O43854 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
EDIL3O43854 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
EDIL3O43854 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
EDIL3O43854 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
EDIL3O43854 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
EDIL3O43854 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
EDIL3O43854 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
EDIL3O43854 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
EDIL3O43854 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
EDIL3O43854 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
EDIL3O43854 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
EDIL3O43854 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
EDIL3O43854 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
EDIL3O43854 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
EDIL3O43854 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
EDIL3O43854 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
EDIL3O43854 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
EDIL3O43854 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
EDIL3O43854 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
EDIL3O43854 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
EDIL3O43854 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
EDIL3O43854 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
EDIL3O43854 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
EDIL3O43854 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
EDIL3O43854 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
EDIL3O43854 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
EDIL3O43854 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
EDIL3O43854 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
EDIL3O43854 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
EDIL3O43854 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
EDIL3O43854 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
EDIL3O43854 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
EDIL3O43854 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
EDIL3O43854 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
EDIL3O43854 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
EDIL3O43854 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
EDIL3O43854 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
EDIL3O43854 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
EDIL3O43854 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
EDIL3O43854 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
EDIL3O43854 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
EDIL3O43854 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
EDIL3O43854 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
EDIL3O43854 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
EDIL3O43854 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
EDIL3O43854 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
EDIL3O43854 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
EDIL3O43854 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
EDIL3O43854 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
EDIL3O43854 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
EDIL3O43854 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
EDIL3O43854 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
EDIL3O43854 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
EDIL3O43854 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
EDIL3O43854 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
EDIL3O43854 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
EDIL3O43854 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
EDIL3O43854 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
EDIL3O43854 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
EDIL3O43854 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
EDIL3O43854 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
EDIL3O43854 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
EDIL3O43854 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
EDIL3O43854 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
EDIL3O43854 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
EDIL3O43854 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
EDIL3O43854 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
EDIL3O43854 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
EDIL3O43854 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
EDIL3O43854 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
EDIL3O43854 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
EDIL3O43854 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
EDIL3O43854 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms