Protein–RNA interactions for Protein: O43365

HOXA3, Homeobox protein Hox-A3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA3O43365 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
HOXA3O43365 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
HOXA3O43365 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
HOXA3O43365 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
HOXA3O43365 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
HOXA3O43365 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
HOXA3O43365 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
HOXA3O43365 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
HOXA3O43365 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
HOXA3O43365 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
HOXA3O43365 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
HOXA3O43365 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
HOXA3O43365 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
HOXA3O43365 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
HOXA3O43365 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
HOXA3O43365 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
HOXA3O43365 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
HOXA3O43365 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
HOXA3O43365 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
HOXA3O43365 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
HOXA3O43365 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
HOXA3O43365 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
HOXA3O43365 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
HOXA3O43365 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
HOXA3O43365 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
HOXA3O43365 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
HOXA3O43365 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
HOXA3O43365 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
HOXA3O43365 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
HOXA3O43365 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
HOXA3O43365 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
HOXA3O43365 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
HOXA3O43365 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
HOXA3O43365 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
HOXA3O43365 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
HOXA3O43365 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
HOXA3O43365 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
HOXA3O43365 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
HOXA3O43365 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
HOXA3O43365 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
HOXA3O43365 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
HOXA3O43365 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
HOXA3O43365 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
HOXA3O43365 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
HOXA3O43365 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
HOXA3O43365 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
HOXA3O43365 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
HOXA3O43365 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
HOXA3O43365 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
HOXA3O43365 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC12.68□□□□□ -0.38
HOXA3O43365 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
HOXA3O43365 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
HOXA3O43365 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
HOXA3O43365 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
HOXA3O43365 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
HOXA3O43365 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
HOXA3O43365 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
HOXA3O43365 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
HOXA3O43365 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
HOXA3O43365 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
HOXA3O43365 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
HOXA3O43365 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
HOXA3O43365 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
HOXA3O43365 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
HOXA3O43365 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
HOXA3O43365 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
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HOXA3O43365 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
HOXA3O43365 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
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HOXA3O43365 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
HOXA3O43365 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
HOXA3O43365 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
HOXA3O43365 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
HOXA3O43365 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
HOXA3O43365 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
HOXA3O43365 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
HOXA3O43365 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
HOXA3O43365 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
HOXA3O43365 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
HOXA3O43365 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
HOXA3O43365 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
HOXA3O43365 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
HOXA3O43365 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
HOXA3O43365 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
HOXA3O43365 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
HOXA3O43365 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
HOXA3O43365 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
HOXA3O43365 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
HOXA3O43365 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
HOXA3O43365 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
HOXA3O43365 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
HOXA3O43365 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
HOXA3O43365 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
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