Protein–RNA interactions for Protein: O00203

AP3B1, AP-3 complex subunit beta-1, humanhuman

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Length 1,094 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3B1O00203 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
AP3B1O00203 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
AP3B1O00203 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
AP3B1O00203 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
AP3B1O00203 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
AP3B1O00203 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
AP3B1O00203 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
AP3B1O00203 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
AP3B1O00203 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
AP3B1O00203 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
AP3B1O00203 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
AP3B1O00203 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
AP3B1O00203 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
AP3B1O00203 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
AP3B1O00203 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
AP3B1O00203 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
AP3B1O00203 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
AP3B1O00203 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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AP3B1O00203 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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AP3B1O00203 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
AP3B1O00203 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
AP3B1O00203 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
AP3B1O00203 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
AP3B1O00203 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
AP3B1O00203 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
AP3B1O00203 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
AP3B1O00203 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
AP3B1O00203 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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AP3B1O00203 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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AP3B1O00203 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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AP3B1O00203 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
AP3B1O00203 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
AP3B1O00203 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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AP3B1O00203 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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AP3B1O00203 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
AP3B1O00203 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
AP3B1O00203 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
AP3B1O00203 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
AP3B1O00203 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
AP3B1O00203 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
AP3B1O00203 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
AP3B1O00203 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
AP3B1O00203 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
AP3B1O00203 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
AP3B1O00203 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
AP3B1O00203 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
AP3B1O00203 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
AP3B1O00203 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
AP3B1O00203 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
AP3B1O00203 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
AP3B1O00203 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
AP3B1O00203 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
AP3B1O00203 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
AP3B1O00203 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
AP3B1O00203 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
AP3B1O00203 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
AP3B1O00203 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
AP3B1O00203 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
AP3B1O00203 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
AP3B1O00203 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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