Protein–RNA interactions for Protein: C9JLW8

MCRIP1, Mapk-regulated corepressor-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCRIP1C9JLW8 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
MCRIP1C9JLW8 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
MCRIP1C9JLW8 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
MCRIP1C9JLW8 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
MCRIP1C9JLW8 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
MCRIP1C9JLW8 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
MCRIP1C9JLW8 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
MCRIP1C9JLW8 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
MCRIP1C9JLW8 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
MCRIP1C9JLW8 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
MCRIP1C9JLW8 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC13.67□□□□□ -0.22
MCRIP1C9JLW8 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
MCRIP1C9JLW8 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
MCRIP1C9JLW8 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
MCRIP1C9JLW8 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
MCRIP1C9JLW8 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
MCRIP1C9JLW8 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
MCRIP1C9JLW8 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
MCRIP1C9JLW8 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
MCRIP1C9JLW8 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
MCRIP1C9JLW8 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
MCRIP1C9JLW8 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
MCRIP1C9JLW8 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
MCRIP1C9JLW8 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
MCRIP1C9JLW8 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
MCRIP1C9JLW8 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
MCRIP1C9JLW8 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
MCRIP1C9JLW8 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
MCRIP1C9JLW8 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
MCRIP1C9JLW8 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
MCRIP1C9JLW8 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
MCRIP1C9JLW8 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
MCRIP1C9JLW8 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
MCRIP1C9JLW8 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
MCRIP1C9JLW8 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
MCRIP1C9JLW8 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
MCRIP1C9JLW8 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
MCRIP1C9JLW8 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
MCRIP1C9JLW8 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
MCRIP1C9JLW8 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
MCRIP1C9JLW8 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
MCRIP1C9JLW8 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
MCRIP1C9JLW8 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
MCRIP1C9JLW8 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
MCRIP1C9JLW8 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
MCRIP1C9JLW8 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
MCRIP1C9JLW8 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
MCRIP1C9JLW8 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
MCRIP1C9JLW8 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
MCRIP1C9JLW8 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
MCRIP1C9JLW8 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
MCRIP1C9JLW8 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
MCRIP1C9JLW8 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
MCRIP1C9JLW8 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
MCRIP1C9JLW8 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
MCRIP1C9JLW8 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
MCRIP1C9JLW8 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
MCRIP1C9JLW8 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
MCRIP1C9JLW8 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
MCRIP1C9JLW8 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
MCRIP1C9JLW8 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
MCRIP1C9JLW8 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
MCRIP1C9JLW8 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
MCRIP1C9JLW8 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
MCRIP1C9JLW8 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
MCRIP1C9JLW8 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
MCRIP1C9JLW8 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
MCRIP1C9JLW8 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
MCRIP1C9JLW8 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
MCRIP1C9JLW8 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
MCRIP1C9JLW8 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
MCRIP1C9JLW8 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
MCRIP1C9JLW8 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
MCRIP1C9JLW8 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
MCRIP1C9JLW8 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
MCRIP1C9JLW8 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
MCRIP1C9JLW8 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
MCRIP1C9JLW8 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
MCRIP1C9JLW8 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
MCRIP1C9JLW8 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
MCRIP1C9JLW8 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
MCRIP1C9JLW8 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
MCRIP1C9JLW8 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
MCRIP1C9JLW8 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
MCRIP1C9JLW8 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
MCRIP1C9JLW8 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
MCRIP1C9JLW8 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
MCRIP1C9JLW8 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
MCRIP1C9JLW8 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
MCRIP1C9JLW8 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
MCRIP1C9JLW8 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
MCRIP1C9JLW8 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
MCRIP1C9JLW8 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
MCRIP1C9JLW8 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
MCRIP1C9JLW8 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
MCRIP1C9JLW8 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
MCRIP1C9JLW8 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
MCRIP1C9JLW8 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
MCRIP1C9JLW8 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
MCRIP1C9JLW8 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
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