Protein–RNA interactions for Protein: B2RPK0

HMGB1P1, Putative high mobility group protein B1-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB1P1B2RPK0 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HMGB1P1B2RPK0 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HMGB1P1B2RPK0 FASN-206ENST00000634990 8407 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HMGB1P1B2RPK0 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HMGB1P1B2RPK0 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HMGB1P1B2RPK0 LONP1-202ENST00000540670 3002 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HMGB1P1B2RPK0 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HMGB1P1B2RPK0 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HMGB1P1B2RPK0 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HMGB1P1B2RPK0 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HMGB1P1B2RPK0 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HMGB1P1B2RPK0 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HMGB1P1B2RPK0 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HMGB1P1B2RPK0 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HMGB1P1B2RPK0 AL359881.3-201ENST00000602640 1721 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
HMGB1P1B2RPK0 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HMGB1P1B2RPK0 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HMGB1P1B2RPK0 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HMGB1P1B2RPK0 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HMGB1P1B2RPK0 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HMGB1P1B2RPK0 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HMGB1P1B2RPK0 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HMGB1P1B2RPK0 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
HMGB1P1B2RPK0 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
HMGB1P1B2RPK0 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HMGB1P1B2RPK0 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HMGB1P1B2RPK0 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HMGB1P1B2RPK0 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HMGB1P1B2RPK0 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
HMGB1P1B2RPK0 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
HMGB1P1B2RPK0 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HMGB1P1B2RPK0 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HMGB1P1B2RPK0 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HMGB1P1B2RPK0 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HMGB1P1B2RPK0 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HMGB1P1B2RPK0 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HMGB1P1B2RPK0 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HMGB1P1B2RPK0 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HMGB1P1B2RPK0 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HMGB1P1B2RPK0 AC079447.1-201ENST00000424491 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HMGB1P1B2RPK0 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HMGB1P1B2RPK0 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HMGB1P1B2RPK0 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HMGB1P1B2RPK0 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HMGB1P1B2RPK0 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HMGB1P1B2RPK0 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HMGB1P1B2RPK0 ADAM15-206ENST00000368412 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HMGB1P1B2RPK0 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HMGB1P1B2RPK0 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HMGB1P1B2RPK0 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HMGB1P1B2RPK0 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HMGB1P1B2RPK0 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HMGB1P1B2RPK0 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HMGB1P1B2RPK0 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HMGB1P1B2RPK0 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HMGB1P1B2RPK0 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HMGB1P1B2RPK0 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HMGB1P1B2RPK0 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HMGB1P1B2RPK0 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HMGB1P1B2RPK0 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
HMGB1P1B2RPK0 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HMGB1P1B2RPK0 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HMGB1P1B2RPK0 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HMGB1P1B2RPK0 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HMGB1P1B2RPK0 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
HMGB1P1B2RPK0 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HMGB1P1B2RPK0 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
HMGB1P1B2RPK0 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
HMGB1P1B2RPK0 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HMGB1P1B2RPK0 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
HMGB1P1B2RPK0 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
HMGB1P1B2RPK0 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
HMGB1P1B2RPK0 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
HMGB1P1B2RPK0 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HMGB1P1B2RPK0 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HMGB1P1B2RPK0 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
HMGB1P1B2RPK0 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HMGB1P1B2RPK0 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HMGB1P1B2RPK0 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HMGB1P1B2RPK0 CSPG4P12-202ENST00000559989 7790 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HMGB1P1B2RPK0 AMMECR1-203ENST00000372059 3052 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HMGB1P1B2RPK0 CAMKK2-209ENST00000446440 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HMGB1P1B2RPK0 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
HMGB1P1B2RPK0 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HMGB1P1B2RPK0 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HMGB1P1B2RPK0 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HMGB1P1B2RPK0 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HMGB1P1B2RPK0 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
HMGB1P1B2RPK0 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HMGB1P1B2RPK0 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HMGB1P1B2RPK0 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HMGB1P1B2RPK0 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HMGB1P1B2RPK0 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HMGB1P1B2RPK0 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
HMGB1P1B2RPK0 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HMGB1P1B2RPK0 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HMGB1P1B2RPK0 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HMGB1P1B2RPK0 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HMGB1P1B2RPK0 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HMGB1P1B2RPK0 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms