Protein–RNA interactions for Protein: B0YJ81

HACD1, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 1, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACD1B0YJ81 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HACD1B0YJ81 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HACD1B0YJ81 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HACD1B0YJ81 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HACD1B0YJ81 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HACD1B0YJ81 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
HACD1B0YJ81 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HACD1B0YJ81 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
HACD1B0YJ81 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HACD1B0YJ81 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HACD1B0YJ81 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
HACD1B0YJ81 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HACD1B0YJ81 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HACD1B0YJ81 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HACD1B0YJ81 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HACD1B0YJ81 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HACD1B0YJ81 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HACD1B0YJ81 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HACD1B0YJ81 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HACD1B0YJ81 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HACD1B0YJ81 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HACD1B0YJ81 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HACD1B0YJ81 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
HACD1B0YJ81 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
HACD1B0YJ81 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HACD1B0YJ81 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HACD1B0YJ81 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HACD1B0YJ81 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HACD1B0YJ81 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HACD1B0YJ81 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HACD1B0YJ81 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
HACD1B0YJ81 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
HACD1B0YJ81 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HACD1B0YJ81 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HACD1B0YJ81 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HACD1B0YJ81 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HACD1B0YJ81 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HACD1B0YJ81 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HACD1B0YJ81 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HACD1B0YJ81 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HACD1B0YJ81 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HACD1B0YJ81 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HACD1B0YJ81 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HACD1B0YJ81 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HACD1B0YJ81 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HACD1B0YJ81 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HACD1B0YJ81 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HACD1B0YJ81 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HACD1B0YJ81 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HACD1B0YJ81 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HACD1B0YJ81 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HACD1B0YJ81 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HACD1B0YJ81 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HACD1B0YJ81 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HACD1B0YJ81 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
HACD1B0YJ81 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
HACD1B0YJ81 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
HACD1B0YJ81 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HACD1B0YJ81 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HACD1B0YJ81 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HACD1B0YJ81 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HACD1B0YJ81 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HACD1B0YJ81 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HACD1B0YJ81 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HACD1B0YJ81 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HACD1B0YJ81 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HACD1B0YJ81 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HACD1B0YJ81 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HACD1B0YJ81 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HACD1B0YJ81 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HACD1B0YJ81 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HACD1B0YJ81 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HACD1B0YJ81 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HACD1B0YJ81 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HACD1B0YJ81 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HACD1B0YJ81 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HACD1B0YJ81 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HACD1B0YJ81 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HACD1B0YJ81 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HACD1B0YJ81 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HACD1B0YJ81 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HACD1B0YJ81 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HACD1B0YJ81 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HACD1B0YJ81 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HACD1B0YJ81 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HACD1B0YJ81 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HACD1B0YJ81 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HACD1B0YJ81 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
HACD1B0YJ81 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HACD1B0YJ81 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
HACD1B0YJ81 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HACD1B0YJ81 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HACD1B0YJ81 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
HACD1B0YJ81 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
HACD1B0YJ81 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HACD1B0YJ81 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HACD1B0YJ81 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HACD1B0YJ81 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HACD1B0YJ81 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HACD1B0YJ81 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 882.7 ms