Protein–RNA interactions for Protein: A6NJU9

NPIPB13, Nuclear pore complex-interacting protein family member B13, humanhuman

Predictions only

Length 1,138 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPB13A6NJU9 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NPIPB13A6NJU9 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NPIPB13A6NJU9 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NPIPB13A6NJU9 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NPIPB13A6NJU9 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NPIPB13A6NJU9 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
NPIPB13A6NJU9 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
NPIPB13A6NJU9 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NPIPB13A6NJU9 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NPIPB13A6NJU9 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NPIPB13A6NJU9 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
NPIPB13A6NJU9 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
NPIPB13A6NJU9 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.19
NPIPB13A6NJU9 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.19
NPIPB13A6NJU9 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
NPIPB13A6NJU9 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NPIPB13A6NJU9 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
NPIPB13A6NJU9 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NPIPB13A6NJU9 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NPIPB13A6NJU9 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NPIPB13A6NJU9 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
NPIPB13A6NJU9 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NPIPB13A6NJU9 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NPIPB13A6NJU9 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NPIPB13A6NJU9 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NPIPB13A6NJU9 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
NPIPB13A6NJU9 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
NPIPB13A6NJU9 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NPIPB13A6NJU9 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
NPIPB13A6NJU9 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NPIPB13A6NJU9 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NPIPB13A6NJU9 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
NPIPB13A6NJU9 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NPIPB13A6NJU9 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
NPIPB13A6NJU9 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
NPIPB13A6NJU9 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NPIPB13A6NJU9 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC13.89□□□□□ -0.19
NPIPB13A6NJU9 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
NPIPB13A6NJU9 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
NPIPB13A6NJU9 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
NPIPB13A6NJU9 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
NPIPB13A6NJU9 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
NPIPB13A6NJU9 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
NPIPB13A6NJU9 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
NPIPB13A6NJU9 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
NPIPB13A6NJU9 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
NPIPB13A6NJU9 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NPIPB13A6NJU9 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NPIPB13A6NJU9 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
NPIPB13A6NJU9 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
NPIPB13A6NJU9 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NPIPB13A6NJU9 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
NPIPB13A6NJU9 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
NPIPB13A6NJU9 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NPIPB13A6NJU9 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NPIPB13A6NJU9 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
NPIPB13A6NJU9 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
NPIPB13A6NJU9 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NPIPB13A6NJU9 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
NPIPB13A6NJU9 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NPIPB13A6NJU9 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
NPIPB13A6NJU9 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NPIPB13A6NJU9 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NPIPB13A6NJU9 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NPIPB13A6NJU9 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NPIPB13A6NJU9 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
NPIPB13A6NJU9 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NPIPB13A6NJU9 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
NPIPB13A6NJU9 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
NPIPB13A6NJU9 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
NPIPB13A6NJU9 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
NPIPB13A6NJU9 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
NPIPB13A6NJU9 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
NPIPB13A6NJU9 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
NPIPB13A6NJU9 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
NPIPB13A6NJU9 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
NPIPB13A6NJU9 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
NPIPB13A6NJU9 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
NPIPB13A6NJU9 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
NPIPB13A6NJU9 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
NPIPB13A6NJU9 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
NPIPB13A6NJU9 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
NPIPB13A6NJU9 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
NPIPB13A6NJU9 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
NPIPB13A6NJU9 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
NPIPB13A6NJU9 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
NPIPB13A6NJU9 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
NPIPB13A6NJU9 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
NPIPB13A6NJU9 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
NPIPB13A6NJU9 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
NPIPB13A6NJU9 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
NPIPB13A6NJU9 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC13.88□□□□□ -0.19
NPIPB13A6NJU9 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
NPIPB13A6NJU9 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
NPIPB13A6NJU9 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
NPIPB13A6NJU9 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
NPIPB13A6NJU9 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
NPIPB13A6NJU9 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC13.88□□□□□ -0.19
NPIPB13A6NJU9 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
NPIPB13A6NJU9 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.1 ms