Protein–RNA interactions for Protein: A6NEM1

GOLGA6L9, Golgin subfamily A member 6-like protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6L9A6NEM1 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GOLGA6L9A6NEM1 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GOLGA6L9A6NEM1 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GOLGA6L9A6NEM1 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GOLGA6L9A6NEM1 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
GOLGA6L9A6NEM1 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GOLGA6L9A6NEM1 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GOLGA6L9A6NEM1 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
GOLGA6L9A6NEM1 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
GOLGA6L9A6NEM1 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
GOLGA6L9A6NEM1 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
GOLGA6L9A6NEM1 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GOLGA6L9A6NEM1 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GOLGA6L9A6NEM1 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GOLGA6L9A6NEM1 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GOLGA6L9A6NEM1 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GOLGA6L9A6NEM1 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GOLGA6L9A6NEM1 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GOLGA6L9A6NEM1 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GOLGA6L9A6NEM1 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GOLGA6L9A6NEM1 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GOLGA6L9A6NEM1 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GOLGA6L9A6NEM1 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GOLGA6L9A6NEM1 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GOLGA6L9A6NEM1 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GOLGA6L9A6NEM1 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GOLGA6L9A6NEM1 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GOLGA6L9A6NEM1 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GOLGA6L9A6NEM1 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
GOLGA6L9A6NEM1 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
GOLGA6L9A6NEM1 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
GOLGA6L9A6NEM1 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
GOLGA6L9A6NEM1 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
GOLGA6L9A6NEM1 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
GOLGA6L9A6NEM1 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
GOLGA6L9A6NEM1 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GOLGA6L9A6NEM1 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GOLGA6L9A6NEM1 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GOLGA6L9A6NEM1 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GOLGA6L9A6NEM1 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GOLGA6L9A6NEM1 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GOLGA6L9A6NEM1 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
GOLGA6L9A6NEM1 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
GOLGA6L9A6NEM1 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GOLGA6L9A6NEM1 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GOLGA6L9A6NEM1 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GOLGA6L9A6NEM1 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GOLGA6L9A6NEM1 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GOLGA6L9A6NEM1 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
GOLGA6L9A6NEM1 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GOLGA6L9A6NEM1 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GOLGA6L9A6NEM1 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
GOLGA6L9A6NEM1 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GOLGA6L9A6NEM1 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GOLGA6L9A6NEM1 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GOLGA6L9A6NEM1 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GOLGA6L9A6NEM1 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GOLGA6L9A6NEM1 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GOLGA6L9A6NEM1 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GOLGA6L9A6NEM1 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GOLGA6L9A6NEM1 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GOLGA6L9A6NEM1 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GOLGA6L9A6NEM1 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GOLGA6L9A6NEM1 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GOLGA6L9A6NEM1 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GOLGA6L9A6NEM1 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GOLGA6L9A6NEM1 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GOLGA6L9A6NEM1 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GOLGA6L9A6NEM1 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GOLGA6L9A6NEM1 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GOLGA6L9A6NEM1 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GOLGA6L9A6NEM1 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GOLGA6L9A6NEM1 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GOLGA6L9A6NEM1 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GOLGA6L9A6NEM1 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GOLGA6L9A6NEM1 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GOLGA6L9A6NEM1 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GOLGA6L9A6NEM1 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GOLGA6L9A6NEM1 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GOLGA6L9A6NEM1 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GOLGA6L9A6NEM1 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GOLGA6L9A6NEM1 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GOLGA6L9A6NEM1 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GOLGA6L9A6NEM1 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GOLGA6L9A6NEM1 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GOLGA6L9A6NEM1 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GOLGA6L9A6NEM1 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GOLGA6L9A6NEM1 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
GOLGA6L9A6NEM1 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GOLGA6L9A6NEM1 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GOLGA6L9A6NEM1 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GOLGA6L9A6NEM1 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GOLGA6L9A6NEM1 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GOLGA6L9A6NEM1 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GOLGA6L9A6NEM1 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GOLGA6L9A6NEM1 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GOLGA6L9A6NEM1 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GOLGA6L9A6NEM1 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GOLGA6L9A6NEM1 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GOLGA6L9A6NEM1 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms