Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4K3

TRAF6, TNF receptor-associated factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF6Q9Y4K3 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRAF6Q9Y4K3 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRAF6Q9Y4K3 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRAF6Q9Y4K3 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRAF6Q9Y4K3 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
TRAF6Q9Y4K3 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRAF6Q9Y4K3 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRAF6Q9Y4K3 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRAF6Q9Y4K3 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRAF6Q9Y4K3 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRAF6Q9Y4K3 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRAF6Q9Y4K3 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRAF6Q9Y4K3 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
TRAF6Q9Y4K3 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRAF6Q9Y4K3 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRAF6Q9Y4K3 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRAF6Q9Y4K3 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRAF6Q9Y4K3 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRAF6Q9Y4K3 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRAF6Q9Y4K3 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRAF6Q9Y4K3 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRAF6Q9Y4K3 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRAF6Q9Y4K3 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRAF6Q9Y4K3 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRAF6Q9Y4K3 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRAF6Q9Y4K3 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRAF6Q9Y4K3 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRAF6Q9Y4K3 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRAF6Q9Y4K3 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
TRAF6Q9Y4K3 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRAF6Q9Y4K3 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRAF6Q9Y4K3 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
TRAF6Q9Y4K3 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRAF6Q9Y4K3 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRAF6Q9Y4K3 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRAF6Q9Y4K3 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRAF6Q9Y4K3 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRAF6Q9Y4K3 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRAF6Q9Y4K3 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRAF6Q9Y4K3 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRAF6Q9Y4K3 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRAF6Q9Y4K3 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRAF6Q9Y4K3 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRAF6Q9Y4K3 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRAF6Q9Y4K3 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRAF6Q9Y4K3 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRAF6Q9Y4K3 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
TRAF6Q9Y4K3 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TRAF6Q9Y4K3 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
TRAF6Q9Y4K3 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
TRAF6Q9Y4K3 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRAF6Q9Y4K3 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRAF6Q9Y4K3 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
TRAF6Q9Y4K3 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRAF6Q9Y4K3 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRAF6Q9Y4K3 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRAF6Q9Y4K3 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRAF6Q9Y4K3 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRAF6Q9Y4K3 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRAF6Q9Y4K3 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRAF6Q9Y4K3 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRAF6Q9Y4K3 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRAF6Q9Y4K3 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRAF6Q9Y4K3 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRAF6Q9Y4K3 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRAF6Q9Y4K3 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRAF6Q9Y4K3 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRAF6Q9Y4K3 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRAF6Q9Y4K3 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRAF6Q9Y4K3 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRAF6Q9Y4K3 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRAF6Q9Y4K3 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRAF6Q9Y4K3 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRAF6Q9Y4K3 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRAF6Q9Y4K3 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRAF6Q9Y4K3 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRAF6Q9Y4K3 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRAF6Q9Y4K3 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRAF6Q9Y4K3 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRAF6Q9Y4K3 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRAF6Q9Y4K3 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRAF6Q9Y4K3 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRAF6Q9Y4K3 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRAF6Q9Y4K3 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
TRAF6Q9Y4K3 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRAF6Q9Y4K3 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRAF6Q9Y4K3 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRAF6Q9Y4K3 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRAF6Q9Y4K3 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRAF6Q9Y4K3 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRAF6Q9Y4K3 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRAF6Q9Y4K3 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRAF6Q9Y4K3 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRAF6Q9Y4K3 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRAF6Q9Y4K3 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TRAF6Q9Y4K3 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TRAF6Q9Y4K3 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TRAF6Q9Y4K3 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRAF6Q9Y4K3 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRAF6Q9Y4K3 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.5 ms