Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPU5

USP24, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 24, humanhuman

Predictions only

Length 2,620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP24Q9UPU5 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
USP24Q9UPU5 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP24Q9UPU5 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP24Q9UPU5 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP24Q9UPU5 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP24Q9UPU5 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP24Q9UPU5 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP24Q9UPU5 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP24Q9UPU5 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP24Q9UPU5 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP24Q9UPU5 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP24Q9UPU5 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP24Q9UPU5 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP24Q9UPU5 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP24Q9UPU5 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP24Q9UPU5 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP24Q9UPU5 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP24Q9UPU5 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP24Q9UPU5 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP24Q9UPU5 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
USP24Q9UPU5 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP24Q9UPU5 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP24Q9UPU5 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP24Q9UPU5 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
USP24Q9UPU5 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP24Q9UPU5 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP24Q9UPU5 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP24Q9UPU5 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP24Q9UPU5 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
USP24Q9UPU5 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
USP24Q9UPU5 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP24Q9UPU5 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP24Q9UPU5 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP24Q9UPU5 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP24Q9UPU5 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP24Q9UPU5 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP24Q9UPU5 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
USP24Q9UPU5 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP24Q9UPU5 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP24Q9UPU5 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP24Q9UPU5 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP24Q9UPU5 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
USP24Q9UPU5 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
USP24Q9UPU5 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
USP24Q9UPU5 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP24Q9UPU5 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP24Q9UPU5 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP24Q9UPU5 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP24Q9UPU5 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP24Q9UPU5 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP24Q9UPU5 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP24Q9UPU5 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP24Q9UPU5 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP24Q9UPU5 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP24Q9UPU5 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP24Q9UPU5 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
USP24Q9UPU5 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
USP24Q9UPU5 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
USP24Q9UPU5 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
USP24Q9UPU5 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
USP24Q9UPU5 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
USP24Q9UPU5 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
USP24Q9UPU5 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
USP24Q9UPU5 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
USP24Q9UPU5 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
USP24Q9UPU5 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP24Q9UPU5 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP24Q9UPU5 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP24Q9UPU5 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP24Q9UPU5 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
USP24Q9UPU5 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP24Q9UPU5 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
USP24Q9UPU5 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
USP24Q9UPU5 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
USP24Q9UPU5 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
USP24Q9UPU5 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
USP24Q9UPU5 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
USP24Q9UPU5 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
USP24Q9UPU5 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
USP24Q9UPU5 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
USP24Q9UPU5 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
USP24Q9UPU5 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
USP24Q9UPU5 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
USP24Q9UPU5 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
USP24Q9UPU5 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
USP24Q9UPU5 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
USP24Q9UPU5 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
USP24Q9UPU5 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
USP24Q9UPU5 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
USP24Q9UPU5 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
USP24Q9UPU5 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
USP24Q9UPU5 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
USP24Q9UPU5 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP24Q9UPU5 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP24Q9UPU5 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP24Q9UPU5 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP24Q9UPU5 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP24Q9UPU5 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP24Q9UPU5 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP24Q9UPU5 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.8 ms