Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULD9

ZNF608, Zinc finger protein 608, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,512 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF608Q9ULD9 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC39.46■■■■□ 3.91
ZNF608Q9ULD9 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC39.46■■■■□ 3.91
ZNF608Q9ULD9 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.46■■■■□ 3.91
ZNF608Q9ULD9 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.45■■■■□ 3.91
ZNF608Q9ULD9 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC39.45■■■■□ 3.91
ZNF608Q9ULD9 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC39.45■■■■□ 3.91
ZNF608Q9ULD9 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC39.45■■■■□ 3.91
ZNF608Q9ULD9 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.45■■■■□ 3.91
ZNF608Q9ULD9 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC39.45■■■■□ 3.91
ZNF608Q9ULD9 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.45■■■■□ 3.91
ZNF608Q9ULD9 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39.45■■■■□ 3.91
ZNF608Q9ULD9 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.44■■■■□ 3.9
ZNF608Q9ULD9 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.44■■■■□ 3.9
ZNF608Q9ULD9 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC39.44■■■■□ 3.9
ZNF608Q9ULD9 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.43■■■■□ 3.9
ZNF608Q9ULD9 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC39.43■■■■□ 3.9
ZNF608Q9ULD9 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC39.43■■■■□ 3.9
ZNF608Q9ULD9 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC39.43■■■■□ 3.9
ZNF608Q9ULD9 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.43■■■■□ 3.9
ZNF608Q9ULD9 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC39.42■■■■□ 3.9
ZNF608Q9ULD9 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.42■■■■□ 3.9
ZNF608Q9ULD9 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC39.42■■■■□ 3.9
ZNF608Q9ULD9 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC39.42■■■■□ 3.9
ZNF608Q9ULD9 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC39.41■■■■□ 3.9
ZNF608Q9ULD9 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.41■■■■□ 3.9
ZNF608Q9ULD9 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.41■■■■□ 3.9
ZNF608Q9ULD9 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC39.4■■■■□ 3.9
ZNF608Q9ULD9 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC39.4■■■■□ 3.9
ZNF608Q9ULD9 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC39.4■■■■□ 3.9
ZNF608Q9ULD9 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC39.4■■■■□ 3.9
ZNF608Q9ULD9 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.39■■■■□ 3.9
ZNF608Q9ULD9 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC39.39■■■■□ 3.9
ZNF608Q9ULD9 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC39.38■■■■□ 3.89
ZNF608Q9ULD9 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC39.38■■■■□ 3.89
ZNF608Q9ULD9 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC39.38■■■■□ 3.89
ZNF608Q9ULD9 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC39.38■■■■□ 3.89
ZNF608Q9ULD9 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC39.38■■■■□ 3.89
ZNF608Q9ULD9 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC39.38■■■■□ 3.89
ZNF608Q9ULD9 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC39.38■■■■□ 3.89
ZNF608Q9ULD9 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.38■■■■□ 3.89
ZNF608Q9ULD9 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.37■■■■□ 3.89
ZNF608Q9ULD9 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC39.37■■■■□ 3.89
ZNF608Q9ULD9 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC39.37■■■■□ 3.89
ZNF608Q9ULD9 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC39.37■■■■□ 3.89
ZNF608Q9ULD9 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC39.37■■■■□ 3.89
ZNF608Q9ULD9 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.36■■■■□ 3.89
ZNF608Q9ULD9 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.36■■■■□ 3.89
ZNF608Q9ULD9 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.36■■■■□ 3.89
ZNF608Q9ULD9 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC39.36■■■■□ 3.89
ZNF608Q9ULD9 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.36■■■■□ 3.89
ZNF608Q9ULD9 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC39.36■■■■□ 3.89
ZNF608Q9ULD9 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC39.36■■■■□ 3.89
ZNF608Q9ULD9 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC39.36■■■■□ 3.89
ZNF608Q9ULD9 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC39.36■■■■□ 3.89
ZNF608Q9ULD9 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC39.35■■■■□ 3.89
ZNF608Q9ULD9 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.35■■■■□ 3.89
ZNF608Q9ULD9 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC39.34■■■■□ 3.89
ZNF608Q9ULD9 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.34■■■■□ 3.89
ZNF608Q9ULD9 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC39.34■■■■□ 3.89
ZNF608Q9ULD9 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.34■■■■□ 3.89
ZNF608Q9ULD9 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.33■■■■□ 3.89
ZNF608Q9ULD9 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.33■■■■□ 3.89
ZNF608Q9ULD9 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.33■■■■□ 3.89
ZNF608Q9ULD9 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC39.33■■■■□ 3.89
ZNF608Q9ULD9 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC39.32■■■■□ 3.89
ZNF608Q9ULD9 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC39.32■■■■□ 3.88
ZNF608Q9ULD9 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC39.32■■■■□ 3.88
ZNF608Q9ULD9 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.32■■■■□ 3.88
ZNF608Q9ULD9 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.32■■■■□ 3.88
ZNF608Q9ULD9 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC39.31■■■■□ 3.88
ZNF608Q9ULD9 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC39.31■■■■□ 3.88
ZNF608Q9ULD9 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC39.31■■■■□ 3.88
ZNF608Q9ULD9 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC39.31■■■■□ 3.88
ZNF608Q9ULD9 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC39.31■■■■□ 3.88
ZNF608Q9ULD9 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC39.31■■■■□ 3.88
ZNF608Q9ULD9 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC39.31■■■■□ 3.88
ZNF608Q9ULD9 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.3■■■■□ 3.88
ZNF608Q9ULD9 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.3■■■■□ 3.88
ZNF608Q9ULD9 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.3■■■■□ 3.88
ZNF608Q9ULD9 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.3■■■■□ 3.88
ZNF608Q9ULD9 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.3■■■■□ 3.88
ZNF608Q9ULD9 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.3■■■■□ 3.88
ZNF608Q9ULD9 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC39.3■■■■□ 3.88
ZNF608Q9ULD9 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC39.3■■■■□ 3.88
ZNF608Q9ULD9 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.3■■■■□ 3.88
ZNF608Q9ULD9 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC39.3■■■■□ 3.88
ZNF608Q9ULD9 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC39.3■■■■□ 3.88
ZNF608Q9ULD9 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC39.29■■■■□ 3.88
ZNF608Q9ULD9 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.29■■■■□ 3.88
ZNF608Q9ULD9 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.29■■■■□ 3.88
ZNF608Q9ULD9 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC39.29■■■■□ 3.88
ZNF608Q9ULD9 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC39.29■■■■□ 3.88
ZNF608Q9ULD9 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.28■■■■□ 3.88
ZNF608Q9ULD9 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC39.28■■■■□ 3.88
ZNF608Q9ULD9 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC39.28■■■■□ 3.88
ZNF608Q9ULD9 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39.28■■■■□ 3.88
ZNF608Q9ULD9 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC39.28■■■■□ 3.88
ZNF608Q9ULD9 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.28■■■■□ 3.88
ZNF608Q9ULD9 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC39.28■■■■□ 3.88
ZNF608Q9ULD9 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC39.28■■■■□ 3.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.6 ms