Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKZ9

PCOLCE2, Procollagen C-endopeptidase enhancer 2, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCOLCE2Q9UKZ9 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PCOLCE2Q9UKZ9 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PCOLCE2Q9UKZ9 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PCOLCE2Q9UKZ9 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PCOLCE2Q9UKZ9 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PCOLCE2Q9UKZ9 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PCOLCE2Q9UKZ9 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PCOLCE2Q9UKZ9 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PCOLCE2Q9UKZ9 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PCOLCE2Q9UKZ9 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PCOLCE2Q9UKZ9 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PCOLCE2Q9UKZ9 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PCOLCE2Q9UKZ9 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PCOLCE2Q9UKZ9 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PCOLCE2Q9UKZ9 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PCOLCE2Q9UKZ9 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PCOLCE2Q9UKZ9 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
PCOLCE2Q9UKZ9 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PCOLCE2Q9UKZ9 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PCOLCE2Q9UKZ9 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PCOLCE2Q9UKZ9 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PCOLCE2Q9UKZ9 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PCOLCE2Q9UKZ9 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PCOLCE2Q9UKZ9 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PCOLCE2Q9UKZ9 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PCOLCE2Q9UKZ9 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PCOLCE2Q9UKZ9 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PCOLCE2Q9UKZ9 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PCOLCE2Q9UKZ9 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PCOLCE2Q9UKZ9 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PCOLCE2Q9UKZ9 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PCOLCE2Q9UKZ9 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PCOLCE2Q9UKZ9 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PCOLCE2Q9UKZ9 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PCOLCE2Q9UKZ9 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PCOLCE2Q9UKZ9 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PCOLCE2Q9UKZ9 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PCOLCE2Q9UKZ9 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
PCOLCE2Q9UKZ9 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
PCOLCE2Q9UKZ9 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PCOLCE2Q9UKZ9 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PCOLCE2Q9UKZ9 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PCOLCE2Q9UKZ9 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PCOLCE2Q9UKZ9 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PCOLCE2Q9UKZ9 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PCOLCE2Q9UKZ9 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PCOLCE2Q9UKZ9 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PCOLCE2Q9UKZ9 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PCOLCE2Q9UKZ9 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PCOLCE2Q9UKZ9 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
PCOLCE2Q9UKZ9 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
PCOLCE2Q9UKZ9 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
PCOLCE2Q9UKZ9 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
PCOLCE2Q9UKZ9 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PCOLCE2Q9UKZ9 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
PCOLCE2Q9UKZ9 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PCOLCE2Q9UKZ9 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PCOLCE2Q9UKZ9 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
PCOLCE2Q9UKZ9 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PCOLCE2Q9UKZ9 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PCOLCE2Q9UKZ9 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PCOLCE2Q9UKZ9 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PCOLCE2Q9UKZ9 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PCOLCE2Q9UKZ9 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PCOLCE2Q9UKZ9 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PCOLCE2Q9UKZ9 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PCOLCE2Q9UKZ9 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
PCOLCE2Q9UKZ9 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PCOLCE2Q9UKZ9 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PCOLCE2Q9UKZ9 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PCOLCE2Q9UKZ9 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PCOLCE2Q9UKZ9 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PCOLCE2Q9UKZ9 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PCOLCE2Q9UKZ9 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PCOLCE2Q9UKZ9 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
PCOLCE2Q9UKZ9 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PCOLCE2Q9UKZ9 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PCOLCE2Q9UKZ9 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PCOLCE2Q9UKZ9 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PCOLCE2Q9UKZ9 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PCOLCE2Q9UKZ9 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PCOLCE2Q9UKZ9 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PCOLCE2Q9UKZ9 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PCOLCE2Q9UKZ9 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PCOLCE2Q9UKZ9 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PCOLCE2Q9UKZ9 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PCOLCE2Q9UKZ9 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PCOLCE2Q9UKZ9 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PCOLCE2Q9UKZ9 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PCOLCE2Q9UKZ9 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PCOLCE2Q9UKZ9 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PCOLCE2Q9UKZ9 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PCOLCE2Q9UKZ9 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PCOLCE2Q9UKZ9 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PCOLCE2Q9UKZ9 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PCOLCE2Q9UKZ9 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
PCOLCE2Q9UKZ9 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PCOLCE2Q9UKZ9 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PCOLCE2Q9UKZ9 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PCOLCE2Q9UKZ9 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms