Protein–RNA interactions for Protein: Q9UH77

KLHL3, Kelch-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL3Q9UH77 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KLHL3Q9UH77 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KLHL3Q9UH77 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
KLHL3Q9UH77 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KLHL3Q9UH77 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KLHL3Q9UH77 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KLHL3Q9UH77 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KLHL3Q9UH77 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KLHL3Q9UH77 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
KLHL3Q9UH77 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KLHL3Q9UH77 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KLHL3Q9UH77 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
KLHL3Q9UH77 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KLHL3Q9UH77 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KLHL3Q9UH77 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KLHL3Q9UH77 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KLHL3Q9UH77 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KLHL3Q9UH77 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KLHL3Q9UH77 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KLHL3Q9UH77 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KLHL3Q9UH77 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KLHL3Q9UH77 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KLHL3Q9UH77 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
KLHL3Q9UH77 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KLHL3Q9UH77 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KLHL3Q9UH77 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KLHL3Q9UH77 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KLHL3Q9UH77 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KLHL3Q9UH77 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
KLHL3Q9UH77 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KLHL3Q9UH77 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KLHL3Q9UH77 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KLHL3Q9UH77 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KLHL3Q9UH77 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KLHL3Q9UH77 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KLHL3Q9UH77 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KLHL3Q9UH77 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KLHL3Q9UH77 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KLHL3Q9UH77 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KLHL3Q9UH77 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KLHL3Q9UH77 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KLHL3Q9UH77 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KLHL3Q9UH77 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KLHL3Q9UH77 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KLHL3Q9UH77 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KLHL3Q9UH77 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KLHL3Q9UH77 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KLHL3Q9UH77 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KLHL3Q9UH77 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KLHL3Q9UH77 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KLHL3Q9UH77 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KLHL3Q9UH77 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KLHL3Q9UH77 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
KLHL3Q9UH77 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KLHL3Q9UH77 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KLHL3Q9UH77 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KLHL3Q9UH77 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KLHL3Q9UH77 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
KLHL3Q9UH77 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KLHL3Q9UH77 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KLHL3Q9UH77 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KLHL3Q9UH77 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KLHL3Q9UH77 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KLHL3Q9UH77 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KLHL3Q9UH77 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
KLHL3Q9UH77 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
KLHL3Q9UH77 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KLHL3Q9UH77 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KLHL3Q9UH77 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KLHL3Q9UH77 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KLHL3Q9UH77 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KLHL3Q9UH77 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KLHL3Q9UH77 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KLHL3Q9UH77 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KLHL3Q9UH77 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KLHL3Q9UH77 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KLHL3Q9UH77 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KLHL3Q9UH77 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KLHL3Q9UH77 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KLHL3Q9UH77 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KLHL3Q9UH77 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KLHL3Q9UH77 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KLHL3Q9UH77 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KLHL3Q9UH77 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KLHL3Q9UH77 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KLHL3Q9UH77 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KLHL3Q9UH77 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KLHL3Q9UH77 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
KLHL3Q9UH77 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KLHL3Q9UH77 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KLHL3Q9UH77 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KLHL3Q9UH77 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KLHL3Q9UH77 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KLHL3Q9UH77 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
KLHL3Q9UH77 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
KLHL3Q9UH77 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
KLHL3Q9UH77 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
KLHL3Q9UH77 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
KLHL3Q9UH77 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
KLHL3Q9UH77 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms