Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBP9

GULP1, PTB domain-containing engulfment adapter protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 304 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GULP1Q9UBP9 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GULP1Q9UBP9 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GULP1Q9UBP9 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GULP1Q9UBP9 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GULP1Q9UBP9 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GULP1Q9UBP9 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GULP1Q9UBP9 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
GULP1Q9UBP9 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GULP1Q9UBP9 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GULP1Q9UBP9 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GULP1Q9UBP9 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GULP1Q9UBP9 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GULP1Q9UBP9 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GULP1Q9UBP9 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GULP1Q9UBP9 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
GULP1Q9UBP9 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GULP1Q9UBP9 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GULP1Q9UBP9 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GULP1Q9UBP9 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GULP1Q9UBP9 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GULP1Q9UBP9 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
GULP1Q9UBP9 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
GULP1Q9UBP9 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
GULP1Q9UBP9 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
GULP1Q9UBP9 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GULP1Q9UBP9 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
GULP1Q9UBP9 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GULP1Q9UBP9 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GULP1Q9UBP9 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GULP1Q9UBP9 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GULP1Q9UBP9 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GULP1Q9UBP9 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GULP1Q9UBP9 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GULP1Q9UBP9 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GULP1Q9UBP9 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GULP1Q9UBP9 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GULP1Q9UBP9 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GULP1Q9UBP9 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GULP1Q9UBP9 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GULP1Q9UBP9 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GULP1Q9UBP9 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GULP1Q9UBP9 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GULP1Q9UBP9 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GULP1Q9UBP9 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GULP1Q9UBP9 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GULP1Q9UBP9 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GULP1Q9UBP9 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GULP1Q9UBP9 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GULP1Q9UBP9 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GULP1Q9UBP9 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GULP1Q9UBP9 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GULP1Q9UBP9 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
GULP1Q9UBP9 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GULP1Q9UBP9 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GULP1Q9UBP9 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
GULP1Q9UBP9 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
GULP1Q9UBP9 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GULP1Q9UBP9 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GULP1Q9UBP9 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GULP1Q9UBP9 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GULP1Q9UBP9 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GULP1Q9UBP9 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GULP1Q9UBP9 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GULP1Q9UBP9 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GULP1Q9UBP9 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GULP1Q9UBP9 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GULP1Q9UBP9 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GULP1Q9UBP9 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GULP1Q9UBP9 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GULP1Q9UBP9 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GULP1Q9UBP9 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GULP1Q9UBP9 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GULP1Q9UBP9 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GULP1Q9UBP9 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GULP1Q9UBP9 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GULP1Q9UBP9 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GULP1Q9UBP9 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GULP1Q9UBP9 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GULP1Q9UBP9 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GULP1Q9UBP9 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GULP1Q9UBP9 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GULP1Q9UBP9 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GULP1Q9UBP9 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GULP1Q9UBP9 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GULP1Q9UBP9 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GULP1Q9UBP9 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GULP1Q9UBP9 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GULP1Q9UBP9 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GULP1Q9UBP9 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GULP1Q9UBP9 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GULP1Q9UBP9 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GULP1Q9UBP9 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GULP1Q9UBP9 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
GULP1Q9UBP9 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GULP1Q9UBP9 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GULP1Q9UBP9 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GULP1Q9UBP9 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
GULP1Q9UBP9 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GULP1Q9UBP9 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GULP1Q9UBP9 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms