Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSB4

KRT82, Keratin, type II cuticular Hb2, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT82Q9NSB4 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KRT82Q9NSB4 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
KRT82Q9NSB4 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
KRT82Q9NSB4 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
KRT82Q9NSB4 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
KRT82Q9NSB4 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
KRT82Q9NSB4 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
KRT82Q9NSB4 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
KRT82Q9NSB4 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
KRT82Q9NSB4 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
KRT82Q9NSB4 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KRT82Q9NSB4 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KRT82Q9NSB4 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KRT82Q9NSB4 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
KRT82Q9NSB4 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KRT82Q9NSB4 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
KRT82Q9NSB4 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KRT82Q9NSB4 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
KRT82Q9NSB4 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KRT82Q9NSB4 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KRT82Q9NSB4 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KRT82Q9NSB4 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KRT82Q9NSB4 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KRT82Q9NSB4 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
KRT82Q9NSB4 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KRT82Q9NSB4 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KRT82Q9NSB4 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KRT82Q9NSB4 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
KRT82Q9NSB4 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
KRT82Q9NSB4 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KRT82Q9NSB4 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KRT82Q9NSB4 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KRT82Q9NSB4 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
KRT82Q9NSB4 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
KRT82Q9NSB4 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
KRT82Q9NSB4 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
KRT82Q9NSB4 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KRT82Q9NSB4 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KRT82Q9NSB4 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KRT82Q9NSB4 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
KRT82Q9NSB4 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
KRT82Q9NSB4 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
KRT82Q9NSB4 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KRT82Q9NSB4 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KRT82Q9NSB4 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
KRT82Q9NSB4 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KRT82Q9NSB4 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
KRT82Q9NSB4 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
KRT82Q9NSB4 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
KRT82Q9NSB4 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
KRT82Q9NSB4 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KRT82Q9NSB4 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KRT82Q9NSB4 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KRT82Q9NSB4 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KRT82Q9NSB4 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KRT82Q9NSB4 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KRT82Q9NSB4 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KRT82Q9NSB4 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KRT82Q9NSB4 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KRT82Q9NSB4 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KRT82Q9NSB4 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KRT82Q9NSB4 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KRT82Q9NSB4 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
KRT82Q9NSB4 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KRT82Q9NSB4 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KRT82Q9NSB4 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KRT82Q9NSB4 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KRT82Q9NSB4 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KRT82Q9NSB4 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KRT82Q9NSB4 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
KRT82Q9NSB4 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
KRT82Q9NSB4 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.55
KRT82Q9NSB4 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
KRT82Q9NSB4 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
KRT82Q9NSB4 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
KRT82Q9NSB4 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
KRT82Q9NSB4 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
KRT82Q9NSB4 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
KRT82Q9NSB4 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
KRT82Q9NSB4 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KRT82Q9NSB4 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
KRT82Q9NSB4 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
KRT82Q9NSB4 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
KRT82Q9NSB4 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
KRT82Q9NSB4 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KRT82Q9NSB4 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
KRT82Q9NSB4 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KRT82Q9NSB4 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KRT82Q9NSB4 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KRT82Q9NSB4 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
KRT82Q9NSB4 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KRT82Q9NSB4 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KRT82Q9NSB4 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
KRT82Q9NSB4 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KRT82Q9NSB4 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
KRT82Q9NSB4 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
KRT82Q9NSB4 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KRT82Q9NSB4 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
KRT82Q9NSB4 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
KRT82Q9NSB4 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms