Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRR4

DROSHA, Ribonuclease 3, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,374 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DROSHAQ9NRR4 OST4-201ENST00000429985 559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.942e-7■■■■■ 35.9
DROSHAQ9NRR4 TFG-205ENST00000479672 776 ntTSL 335.99■■■■□ 3.351e-11■■■■■ 35.9
DROSHAQ9NRR4 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC32.47■■■□□ 2.791e-11■■■■■ 35.9
DROSHAQ9NRR4 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.651e-11■■■■■ 35.9
DROSHAQ9NRR4 TFG-207ENST00000487505 913 ntTSL 328.18■■■□□ 2.11e-11■■■■■ 35.9
DROSHAQ9NRR4 TFG-203ENST00000463568 723 ntTSL 326.46■■□□□ 1.831e-11■■■■■ 35.9
DROSHAQ9NRR4 TFG-208ENST00000490574 1696 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.781e-11■■■■■ 35.9
DROSHAQ9NRR4 TFG-202ENST00000418917 1716 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.771e-11■■■■■ 35.9
DROSHAQ9NRR4 TFG-204ENST00000476228 1783 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.21e-11■■■■■ 35.9
DROSHAQ9NRR4 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.874e-9■■■■■ 35.9
DROSHAQ9NRR4 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC32.8■■■□□ 2.844e-9■■■■■ 35.9
DROSHAQ9NRR4 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC31.59■■■□□ 2.654e-9■■■■■ 35.9
DROSHAQ9NRR4 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.894e-9■■■■■ 35.9
DROSHAQ9NRR4 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.864e-9■■■■■ 35.9
DROSHAQ9NRR4 GNB2-210ENST00000451587 887 ntTSL 522.49■■□□□ 1.194e-9■■■■■ 35.9
DROSHAQ9NRR4 MTA1-219ENST00000551236 461 ntTSL 318.43■□□□□ 0.541e-7■■■■■ 35.6
DROSHAQ9NRR4 FADS3-209ENST00000529525 530 ntTSL 339.49■■■■□ 3.914e-7■■■■■ 35.6
DROSHAQ9NRR4 ZNF740-204ENST00000552593 966 ntTSL 338.64■■■■□ 3.784e-7■■■■■ 35.6
DROSHAQ9NRR4 HIVEP1-203ENST00000442081 1044 ntTSL 330.58■■■□□ 2.494e-7■■■■■ 35.6
DROSHAQ9NRR4 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.454e-7■■■■■ 35.6
DROSHAQ9NRR4 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.324e-7■■■■■ 35.6
DROSHAQ9NRR4 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.224e-7■■■■■ 35.6
DROSHAQ9NRR4 TRIM73-206ENST00000463766 458 ntTSL 324.77■■□□□ 1.564e-7■■■■■ 35.6
DROSHAQ9NRR4 HIVEP1-204ENST00000478545 576 ntTSL 424.68■■□□□ 1.544e-7■■■■■ 35.6
DROSHAQ9NRR4 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.414e-7■■■■■ 35.6
DROSHAQ9NRR4 UIMC1-202ENST00000417486 1248 ntTSL 221.61■■□□□ 1.054e-7■■■■■ 35.6
DROSHAQ9NRR4 ZBTB2-201ENST00000325144 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.794e-7■■■■■ 35.6
DROSHAQ9NRR4 MEX3B-202ENST00000558133 4333 ntBASIC18.37■□□□□ 0.534e-7■■■■■ 35.6
DROSHAQ9NRR4 MEX3B-201ENST00000329713 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.534e-7■■■■■ 35.6
DROSHAQ9NRR4 UIMC1-209ENST00000509236 619 ntTSL 517.16■□□□□ 0.344e-7■■■■■ 35.6
DROSHAQ9NRR4 AGPAT4-204ENST00000436279 875 ntTSL 1 (best)16.65■□□□□ 0.264e-7■■■■■ 35.6
DROSHAQ9NRR4 UIMC1-212ENST00000511320 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.094e-7■■■■■ 35.6
DROSHAQ9NRR4 ZNF740-201ENST00000416904 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.024e-7■■■■■ 35.6
DROSHAQ9NRR4 UIMC1-213ENST00000512031 2467 ntTSL 513.44□□□□□ -0.264e-7■■■■■ 35.6
DROSHAQ9NRR4 MIER2-201ENST00000264819 6884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.274e-7■■■■■ 35.6
DROSHAQ9NRR4 UIMC1-203ENST00000428382 249 ntTSL 412.38□□□□□ -0.434e-7■■■■■ 35.6
DROSHAQ9NRR4 UIMC1-208ENST00000507513 425 ntTSL 312.36□□□□□ -0.434e-7■■■■■ 35.6
DROSHAQ9NRR4 AGPAT4-203ENST00000366911 7705 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.464e-7■■■■■ 35.6
DROSHAQ9NRR4 AGPAT4-201ENST00000320285 7865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.64e-7■■■■■ 35.6
DROSHAQ9NRR4 UIMC1-207ENST00000506128 1945 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.684e-7■■■■■ 35.6
DROSHAQ9NRR4 UIMC1-214ENST00000515488 587 ntTSL 410.52□□□□□ -0.734e-7■■■■■ 35.6
DROSHAQ9NRR4 SDHB-208ENST00000491274 649 ntTSL 510.02□□□□□ -0.84e-7■■■■■ 35.6
DROSHAQ9NRR4 SDHB-202ENST00000463045 702 ntTSL 36.8□□□□□ -1.324e-7■■■■■ 35.6
DROSHAQ9NRR4 MIR331-201ENST00000362302 94 ntBASIC6.65□□□□□ -1.353e-8■■■■■ 35.6
DROSHAQ9NRR4 SDHB-205ENST00000475506 550 ntTSL 24.28□□□□□ -1.724e-7■■■■■ 35.6
DROSHAQ9NRR4 MIR26A1-201ENST00000362205 77 ntBASIC4.24□□□□□ -1.735e-18■■■■■ 35.6
DROSHAQ9NRR4 CSNK1D-221ENST00000582844 957 ntTSL 532.94■■■□□ 2.862e-11■■■■■ 35.6
DROSHAQ9NRR4 CSNK1D-207ENST00000578194 567 ntTSL 419.43■□□□□ 0.72e-11■■■■■ 35.6
DROSHAQ9NRR4 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.712e-7■■■■■ 35.5
DROSHAQ9NRR4 CTSZ-204ENST00000503833 955 ntTSL 1 (best)34.12■■■■□ 3.052e-7■■■■■ 35.5
DROSHAQ9NRR4 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.212e-7■■■■■ 35.5
DROSHAQ9NRR4 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.862e-7■■■■■ 35.5
DROSHAQ9NRR4 CTSZ-203ENST00000488395 647 ntTSL 226.46■■□□□ 1.832e-7■■■■■ 35.5
DROSHAQ9NRR4 LONP1-211ENST00000590558 2884 ntTSL 525.91■■□□□ 1.742e-7■■■■■ 35.5
DROSHAQ9NRR4 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.712e-7■■■■■ 35.5
DROSHAQ9NRR4 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.162e-7■■■■■ 35.5
DROSHAQ9NRR4 LONP1-206ENST00000587552 2816 ntTSL 221■□□□□ 0.952e-7■■■■■ 35.5
DROSHAQ9NRR4 LONP1-209ENST00000590206 725 ntTSL 319.34■□□□□ 0.692e-7■■■■■ 35.5
DROSHAQ9NRR4 LONP1-202ENST00000540670 3002 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.662e-7■■■■■ 35.5
DROSHAQ9NRR4 NOC4L-204ENST00000541954 1009 ntTSL 523.13■■□□□ 1.291e-6■■■■■ 35.5
DROSHAQ9NRR4 CLCN5-205ENST00000482218 449 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.54e-7■■■■■ 35.3
DROSHAQ9NRR4 CLCN5-203ENST00000376091 3046 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.34e-7■■■■■ 35.3
DROSHAQ9NRR4 CLCN5-202ENST00000376088 10108 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.384e-7■■■■■ 35.3
DROSHAQ9NRR4 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.091e-6■■■■■ 35.2
DROSHAQ9NRR4 POFUT2-203ENST00000349485 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.451e-6■■■■■ 35.2
DROSHAQ9NRR4 POFUT2-202ENST00000334538 3077 ntTSL 1 (best)17.86■□□□□ 0.451e-6■■■■■ 35.2
DROSHAQ9NRR4 POFUT2-213ENST00000612472 2959 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.441e-6■■■■■ 35.2
DROSHAQ9NRR4 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.792e-6■■■■■ 35.2
DROSHAQ9NRR4 PLEC-214ENST00000528131 564 ntTSL 328.9■■■□□ 2.221e-6■■■■■ 35.2
DROSHAQ9NRR4 PLEC-209ENST00000526416 583 ntTSL 325.9■■□□□ 1.745e-7■■■■■ 35.2
DROSHAQ9NRR4 PLEC-212ENST00000527816 583 ntTSL 320.62■□□□□ 0.895e-7■■■■■ 35.2
DROSHAQ9NRR4 KIF13A-210ENST00000506044 810 ntTSL 418.17■□□□□ 0.55e-12■■■■■ 35.2
DROSHAQ9NRR4 KIF13A-201ENST00000259711 5941 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.365e-12■■■■■ 35.2
DROSHAQ9NRR4 KIF13A-213ENST00000636847 5538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.535e-12■■■■■ 35.2
DROSHAQ9NRR4 KIF13A-206ENST00000502297 4009 ntTSL 511.24□□□□□ -0.615e-12■■■■■ 35.2
DROSHAQ9NRR4 KIF13A-204ENST00000378826 5747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.665e-12■■■■■ 35.2
DROSHAQ9NRR4 KIF13A-203ENST00000378814 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.75e-12■■■■■ 35.2
DROSHAQ9NRR4 KIF13A-202ENST00000358380 4200 ntTSL 1 (best)9.84□□□□□ -0.835e-12■■■■■ 35.2
DROSHAQ9NRR4 KIF13A-205ENST00000378843 5707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.955e-12■■■■■ 35.2
DROSHAQ9NRR4 KIF13A-212ENST00000514714 602 ntTSL 43.59□□□□□ -1.835e-12■■■■■ 35.2
DROSHAQ9NRR4 PSMB2-201ENST00000373237 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.321e-15■■■■■ 35.1
DROSHAQ9NRR4 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.277e-7■■■■■ 35.1
DROSHAQ9NRR4 DHRS3-203ENST00000482265 1036 ntTSL 323.36■■□□□ 1.337e-7■■■■■ 35.1
DROSHAQ9NRR4 DHRS3-202ENST00000464917 539 ntTSL 320.99■□□□□ 0.957e-7■■■■■ 35.1
DROSHAQ9NRR4 MIR148B-201ENST00000362252 99 ntBASIC4.33□□□□□ -1.726e-9■■■■■ 35
DROSHAQ9NRR4 DNPH1-204ENST00000509253 834 ntTSL 346.32■■■■■ 5.012e-6■■■■■ 35
DROSHAQ9NRR4 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.152e-6■■■■■ 35
DROSHAQ9NRR4 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC31.21■■■□□ 2.592e-6■■■■■ 35
DROSHAQ9NRR4 GABBR1-207ENST00000467259 1252 ntTSL 236.91■■■■□ 3.52e-7■■■■■ 35
DROSHAQ9NRR4 GABBR1-206ENST00000462632 609 ntTSL 423.14■■□□□ 1.292e-7■■■■■ 35
DROSHAQ9NRR4 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.058e-9■■■■■ 35
DROSHAQ9NRR4 ARRB1-202ENST00000420843 3336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.738e-9■■■■■ 35
DROSHAQ9NRR4 ARRB1-211ENST00000533255 551 ntTSL 217.29■□□□□ 0.368e-9■■■■■ 35
DROSHAQ9NRR4 FTX-216ENST00000638985 1367 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.016e-7■■■■■ 35
DROSHAQ9NRR4 FTX-211ENST00000603672 1077 ntTSL 520.72■□□□□ 0.916e-7■■■■■ 35
DROSHAQ9NRR4 FTX-209ENST00000602812 2356 ntTSL 1 (best)15.47■□□□□ 0.076e-7■■■■■ 35
DROSHAQ9NRR4 FTX-215ENST00000638681 9771 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.646e-7■■■■■ 35
DROSHAQ9NRR4 FTX-206ENST00000602420 751 ntTSL 38.99□□□□□ -0.976e-7■■■■■ 35
DROSHAQ9NRR4 FTX-210ENST00000603037 8347 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.436e-7■■■■■ 35
DROSHAQ9NRR4 GATD1-207ENST00000526650 457 ntTSL 325.17■■□□□ 1.623e-6■■■■■ 34.8
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