Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR80

ARHGEF4, Rho guanine nucleotide exchange factor 4, humanhuman

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Length 690 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF4Q9NR80 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
ARHGEF4Q9NR80 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ARHGEF4Q9NR80 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
ARHGEF4Q9NR80 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ARHGEF4Q9NR80 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ARHGEF4Q9NR80 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
ARHGEF4Q9NR80 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ARHGEF4Q9NR80 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ARHGEF4Q9NR80 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ARHGEF4Q9NR80 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ARHGEF4Q9NR80 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ARHGEF4Q9NR80 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ARHGEF4Q9NR80 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ARHGEF4Q9NR80 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ARHGEF4Q9NR80 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ARHGEF4Q9NR80 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ARHGEF4Q9NR80 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ARHGEF4Q9NR80 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ARHGEF4Q9NR80 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ARHGEF4Q9NR80 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ARHGEF4Q9NR80 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ARHGEF4Q9NR80 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ARHGEF4Q9NR80 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ARHGEF4Q9NR80 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ARHGEF4Q9NR80 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ARHGEF4Q9NR80 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ARHGEF4Q9NR80 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
ARHGEF4Q9NR80 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ARHGEF4Q9NR80 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ARHGEF4Q9NR80 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ARHGEF4Q9NR80 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ARHGEF4Q9NR80 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ARHGEF4Q9NR80 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ARHGEF4Q9NR80 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ARHGEF4Q9NR80 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ARHGEF4Q9NR80 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ARHGEF4Q9NR80 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ARHGEF4Q9NR80 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
ARHGEF4Q9NR80 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
ARHGEF4Q9NR80 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
ARHGEF4Q9NR80 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ARHGEF4Q9NR80 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ARHGEF4Q9NR80 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ARHGEF4Q9NR80 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ARHGEF4Q9NR80 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
ARHGEF4Q9NR80 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ARHGEF4Q9NR80 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ARHGEF4Q9NR80 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ARHGEF4Q9NR80 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ARHGEF4Q9NR80 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
ARHGEF4Q9NR80 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ARHGEF4Q9NR80 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ARHGEF4Q9NR80 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ARHGEF4Q9NR80 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ARHGEF4Q9NR80 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ARHGEF4Q9NR80 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ARHGEF4Q9NR80 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
ARHGEF4Q9NR80 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ARHGEF4Q9NR80 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ARHGEF4Q9NR80 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ARHGEF4Q9NR80 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ARHGEF4Q9NR80 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ARHGEF4Q9NR80 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ARHGEF4Q9NR80 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ARHGEF4Q9NR80 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ARHGEF4Q9NR80 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ARHGEF4Q9NR80 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ARHGEF4Q9NR80 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ARHGEF4Q9NR80 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ARHGEF4Q9NR80 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ARHGEF4Q9NR80 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ARHGEF4Q9NR80 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ARHGEF4Q9NR80 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ARHGEF4Q9NR80 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ARHGEF4Q9NR80 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ARHGEF4Q9NR80 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ARHGEF4Q9NR80 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ARHGEF4Q9NR80 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ARHGEF4Q9NR80 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ARHGEF4Q9NR80 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ARHGEF4Q9NR80 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ARHGEF4Q9NR80 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
ARHGEF4Q9NR80 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ARHGEF4Q9NR80 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ARHGEF4Q9NR80 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
ARHGEF4Q9NR80 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ARHGEF4Q9NR80 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ARHGEF4Q9NR80 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ARHGEF4Q9NR80 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ARHGEF4Q9NR80 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ARHGEF4Q9NR80 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ARHGEF4Q9NR80 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ARHGEF4Q9NR80 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ARHGEF4Q9NR80 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ARHGEF4Q9NR80 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ARHGEF4Q9NR80 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ARHGEF4Q9NR80 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ARHGEF4Q9NR80 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ARHGEF4Q9NR80 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ARHGEF4Q9NR80 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
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