Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ69

LHX9, LIM/homeobox protein Lhx9, humanhuman

Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX9Q9NQ69 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LHX9Q9NQ69 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LHX9Q9NQ69 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
LHX9Q9NQ69 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LHX9Q9NQ69 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LHX9Q9NQ69 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LHX9Q9NQ69 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LHX9Q9NQ69 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LHX9Q9NQ69 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LHX9Q9NQ69 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LHX9Q9NQ69 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
LHX9Q9NQ69 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
LHX9Q9NQ69 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LHX9Q9NQ69 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LHX9Q9NQ69 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LHX9Q9NQ69 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LHX9Q9NQ69 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LHX9Q9NQ69 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LHX9Q9NQ69 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LHX9Q9NQ69 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LHX9Q9NQ69 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LHX9Q9NQ69 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LHX9Q9NQ69 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
LHX9Q9NQ69 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
LHX9Q9NQ69 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LHX9Q9NQ69 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LHX9Q9NQ69 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LHX9Q9NQ69 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LHX9Q9NQ69 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LHX9Q9NQ69 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LHX9Q9NQ69 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LHX9Q9NQ69 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LHX9Q9NQ69 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LHX9Q9NQ69 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LHX9Q9NQ69 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LHX9Q9NQ69 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LHX9Q9NQ69 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LHX9Q9NQ69 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LHX9Q9NQ69 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LHX9Q9NQ69 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LHX9Q9NQ69 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LHX9Q9NQ69 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LHX9Q9NQ69 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LHX9Q9NQ69 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LHX9Q9NQ69 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LHX9Q9NQ69 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LHX9Q9NQ69 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LHX9Q9NQ69 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LHX9Q9NQ69 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LHX9Q9NQ69 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LHX9Q9NQ69 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LHX9Q9NQ69 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LHX9Q9NQ69 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LHX9Q9NQ69 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LHX9Q9NQ69 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LHX9Q9NQ69 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LHX9Q9NQ69 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LHX9Q9NQ69 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LHX9Q9NQ69 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LHX9Q9NQ69 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LHX9Q9NQ69 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LHX9Q9NQ69 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LHX9Q9NQ69 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LHX9Q9NQ69 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LHX9Q9NQ69 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LHX9Q9NQ69 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LHX9Q9NQ69 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LHX9Q9NQ69 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LHX9Q9NQ69 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
LHX9Q9NQ69 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LHX9Q9NQ69 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LHX9Q9NQ69 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LHX9Q9NQ69 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LHX9Q9NQ69 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
LHX9Q9NQ69 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LHX9Q9NQ69 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
LHX9Q9NQ69 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LHX9Q9NQ69 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LHX9Q9NQ69 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LHX9Q9NQ69 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LHX9Q9NQ69 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LHX9Q9NQ69 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LHX9Q9NQ69 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LHX9Q9NQ69 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LHX9Q9NQ69 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LHX9Q9NQ69 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LHX9Q9NQ69 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LHX9Q9NQ69 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LHX9Q9NQ69 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LHX9Q9NQ69 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LHX9Q9NQ69 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LHX9Q9NQ69 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LHX9Q9NQ69 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
LHX9Q9NQ69 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LHX9Q9NQ69 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LHX9Q9NQ69 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
LHX9Q9NQ69 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LHX9Q9NQ69 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LHX9Q9NQ69 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LHX9Q9NQ69 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms