Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP61

ARFGAP3, ADP-ribosylation factor GTPase-activating protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFGAP3Q9NP61 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ARFGAP3Q9NP61 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ARFGAP3Q9NP61 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ARFGAP3Q9NP61 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ARFGAP3Q9NP61 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ARFGAP3Q9NP61 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ARFGAP3Q9NP61 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ARFGAP3Q9NP61 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ARFGAP3Q9NP61 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ARFGAP3Q9NP61 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ARFGAP3Q9NP61 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ARFGAP3Q9NP61 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ARFGAP3Q9NP61 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ARFGAP3Q9NP61 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ARFGAP3Q9NP61 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ARFGAP3Q9NP61 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ARFGAP3Q9NP61 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ARFGAP3Q9NP61 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ARFGAP3Q9NP61 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ARFGAP3Q9NP61 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
ARFGAP3Q9NP61 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ARFGAP3Q9NP61 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ARFGAP3Q9NP61 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ARFGAP3Q9NP61 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ARFGAP3Q9NP61 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ARFGAP3Q9NP61 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ARFGAP3Q9NP61 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ARFGAP3Q9NP61 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ARFGAP3Q9NP61 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ARFGAP3Q9NP61 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ARFGAP3Q9NP61 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ARFGAP3Q9NP61 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ARFGAP3Q9NP61 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ARFGAP3Q9NP61 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ARFGAP3Q9NP61 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ARFGAP3Q9NP61 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
ARFGAP3Q9NP61 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ARFGAP3Q9NP61 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ARFGAP3Q9NP61 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ARFGAP3Q9NP61 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ARFGAP3Q9NP61 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ARFGAP3Q9NP61 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ARFGAP3Q9NP61 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ARFGAP3Q9NP61 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ARFGAP3Q9NP61 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ARFGAP3Q9NP61 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
ARFGAP3Q9NP61 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ARFGAP3Q9NP61 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ARFGAP3Q9NP61 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ARFGAP3Q9NP61 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ARFGAP3Q9NP61 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ARFGAP3Q9NP61 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ARFGAP3Q9NP61 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
ARFGAP3Q9NP61 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ARFGAP3Q9NP61 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ARFGAP3Q9NP61 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
ARFGAP3Q9NP61 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ARFGAP3Q9NP61 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ARFGAP3Q9NP61 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ARFGAP3Q9NP61 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ARFGAP3Q9NP61 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ARFGAP3Q9NP61 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ARFGAP3Q9NP61 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
ARFGAP3Q9NP61 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ARFGAP3Q9NP61 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
ARFGAP3Q9NP61 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ARFGAP3Q9NP61 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ARFGAP3Q9NP61 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ARFGAP3Q9NP61 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ARFGAP3Q9NP61 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ARFGAP3Q9NP61 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ARFGAP3Q9NP61 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ARFGAP3Q9NP61 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ARFGAP3Q9NP61 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ARFGAP3Q9NP61 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ARFGAP3Q9NP61 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ARFGAP3Q9NP61 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
ARFGAP3Q9NP61 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
ARFGAP3Q9NP61 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ARFGAP3Q9NP61 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ARFGAP3Q9NP61 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ARFGAP3Q9NP61 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ARFGAP3Q9NP61 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ARFGAP3Q9NP61 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ARFGAP3Q9NP61 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ARFGAP3Q9NP61 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ARFGAP3Q9NP61 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ARFGAP3Q9NP61 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ARFGAP3Q9NP61 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ARFGAP3Q9NP61 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ARFGAP3Q9NP61 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ARFGAP3Q9NP61 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ARFGAP3Q9NP61 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
ARFGAP3Q9NP61 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ARFGAP3Q9NP61 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ARFGAP3Q9NP61 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ARFGAP3Q9NP61 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ARFGAP3Q9NP61 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ARFGAP3Q9NP61 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ARFGAP3Q9NP61 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms