Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9D4

ZNF408, Zinc finger protein 408, humanhuman

Predictions only

Length 720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF408Q9H9D4 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ZNF408Q9H9D4 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
ZNF408Q9H9D4 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ZNF408Q9H9D4 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
ZNF408Q9H9D4 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ZNF408Q9H9D4 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ZNF408Q9H9D4 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ZNF408Q9H9D4 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
ZNF408Q9H9D4 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ZNF408Q9H9D4 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
ZNF408Q9H9D4 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
ZNF408Q9H9D4 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
ZNF408Q9H9D4 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
ZNF408Q9H9D4 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ZNF408Q9H9D4 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
ZNF408Q9H9D4 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
ZNF408Q9H9D4 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ZNF408Q9H9D4 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ZNF408Q9H9D4 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC27.76■■■□□ 2.03
ZNF408Q9H9D4 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
ZNF408Q9H9D4 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
ZNF408Q9H9D4 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
ZNF408Q9H9D4 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
ZNF408Q9H9D4 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ZNF408Q9H9D4 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ZNF408Q9H9D4 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ZNF408Q9H9D4 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
ZNF408Q9H9D4 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
ZNF408Q9H9D4 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
ZNF408Q9H9D4 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
ZNF408Q9H9D4 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ZNF408Q9H9D4 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
ZNF408Q9H9D4 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
ZNF408Q9H9D4 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
ZNF408Q9H9D4 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
ZNF408Q9H9D4 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ZNF408Q9H9D4 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ZNF408Q9H9D4 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
ZNF408Q9H9D4 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ZNF408Q9H9D4 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ZNF408Q9H9D4 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
ZNF408Q9H9D4 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ZNF408Q9H9D4 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
ZNF408Q9H9D4 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
ZNF408Q9H9D4 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
ZNF408Q9H9D4 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ZNF408Q9H9D4 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ZNF408Q9H9D4 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
ZNF408Q9H9D4 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
ZNF408Q9H9D4 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ZNF408Q9H9D4 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ZNF408Q9H9D4 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ZNF408Q9H9D4 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
ZNF408Q9H9D4 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
ZNF408Q9H9D4 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
ZNF408Q9H9D4 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
ZNF408Q9H9D4 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
ZNF408Q9H9D4 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
ZNF408Q9H9D4 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ZNF408Q9H9D4 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ZNF408Q9H9D4 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ZNF408Q9H9D4 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ZNF408Q9H9D4 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ZNF408Q9H9D4 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ZNF408Q9H9D4 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ZNF408Q9H9D4 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ZNF408Q9H9D4 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ZNF408Q9H9D4 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ZNF408Q9H9D4 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
ZNF408Q9H9D4 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
ZNF408Q9H9D4 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ZNF408Q9H9D4 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ZNF408Q9H9D4 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ZNF408Q9H9D4 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ZNF408Q9H9D4 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ZNF408Q9H9D4 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ZNF408Q9H9D4 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ZNF408Q9H9D4 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ZNF408Q9H9D4 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ZNF408Q9H9D4 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ZNF408Q9H9D4 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
ZNF408Q9H9D4 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ZNF408Q9H9D4 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ZNF408Q9H9D4 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ZNF408Q9H9D4 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ZNF408Q9H9D4 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ZNF408Q9H9D4 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ZNF408Q9H9D4 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ZNF408Q9H9D4 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ZNF408Q9H9D4 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ZNF408Q9H9D4 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ZNF408Q9H9D4 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ZNF408Q9H9D4 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ZNF408Q9H9D4 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ZNF408Q9H9D4 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ZNF408Q9H9D4 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ZNF408Q9H9D4 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
ZNF408Q9H9D4 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
ZNF408Q9H9D4 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
ZNF408Q9H9D4 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12 ms