Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2D6

TRIOBP, TRIO and F-actin-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 2,365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIOBPQ9H2D6 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRIOBPQ9H2D6 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRIOBPQ9H2D6 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRIOBPQ9H2D6 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRIOBPQ9H2D6 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRIOBPQ9H2D6 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
TRIOBPQ9H2D6 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TRIOBPQ9H2D6 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TRIOBPQ9H2D6 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
TRIOBPQ9H2D6 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
TRIOBPQ9H2D6 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
TRIOBPQ9H2D6 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
TRIOBPQ9H2D6 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
TRIOBPQ9H2D6 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.68
TRIOBPQ9H2D6 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TRIOBPQ9H2D6 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TRIOBPQ9H2D6 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TRIOBPQ9H2D6 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TRIOBPQ9H2D6 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TRIOBPQ9H2D6 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
TRIOBPQ9H2D6 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRIOBPQ9H2D6 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRIOBPQ9H2D6 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
TRIOBPQ9H2D6 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRIOBPQ9H2D6 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRIOBPQ9H2D6 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRIOBPQ9H2D6 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRIOBPQ9H2D6 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TRIOBPQ9H2D6 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TRIOBPQ9H2D6 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TRIOBPQ9H2D6 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TRIOBPQ9H2D6 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TRIOBPQ9H2D6 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TRIOBPQ9H2D6 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TRIOBPQ9H2D6 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TRIOBPQ9H2D6 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TRIOBPQ9H2D6 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TRIOBPQ9H2D6 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TRIOBPQ9H2D6 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TRIOBPQ9H2D6 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TRIOBPQ9H2D6 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TRIOBPQ9H2D6 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TRIOBPQ9H2D6 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TRIOBPQ9H2D6 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TRIOBPQ9H2D6 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TRIOBPQ9H2D6 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRIOBPQ9H2D6 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRIOBPQ9H2D6 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRIOBPQ9H2D6 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRIOBPQ9H2D6 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRIOBPQ9H2D6 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRIOBPQ9H2D6 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRIOBPQ9H2D6 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRIOBPQ9H2D6 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TRIOBPQ9H2D6 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TRIOBPQ9H2D6 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TRIOBPQ9H2D6 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TRIOBPQ9H2D6 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TRIOBPQ9H2D6 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TRIOBPQ9H2D6 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TRIOBPQ9H2D6 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
TRIOBPQ9H2D6 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TRIOBPQ9H2D6 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TRIOBPQ9H2D6 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRIOBPQ9H2D6 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRIOBPQ9H2D6 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRIOBPQ9H2D6 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRIOBPQ9H2D6 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRIOBPQ9H2D6 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRIOBPQ9H2D6 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRIOBPQ9H2D6 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRIOBPQ9H2D6 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRIOBPQ9H2D6 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRIOBPQ9H2D6 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRIOBPQ9H2D6 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
TRIOBPQ9H2D6 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRIOBPQ9H2D6 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
TRIOBPQ9H2D6 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRIOBPQ9H2D6 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRIOBPQ9H2D6 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRIOBPQ9H2D6 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRIOBPQ9H2D6 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRIOBPQ9H2D6 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRIOBPQ9H2D6 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRIOBPQ9H2D6 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
TRIOBPQ9H2D6 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRIOBPQ9H2D6 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRIOBPQ9H2D6 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRIOBPQ9H2D6 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRIOBPQ9H2D6 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
TRIOBPQ9H2D6 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRIOBPQ9H2D6 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRIOBPQ9H2D6 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
TRIOBPQ9H2D6 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRIOBPQ9H2D6 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRIOBPQ9H2D6 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRIOBPQ9H2D6 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRIOBPQ9H2D6 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRIOBPQ9H2D6 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRIOBPQ9H2D6 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.5 ms