Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYW2

SETD2, Histone-lysine N-methyltransferase SETD2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD2Q9BYW2 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SETD2Q9BYW2 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SETD2Q9BYW2 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SETD2Q9BYW2 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
SETD2Q9BYW2 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SETD2Q9BYW2 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SETD2Q9BYW2 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SETD2Q9BYW2 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SETD2Q9BYW2 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SETD2Q9BYW2 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SETD2Q9BYW2 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SETD2Q9BYW2 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SETD2Q9BYW2 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SETD2Q9BYW2 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SETD2Q9BYW2 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SETD2Q9BYW2 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
SETD2Q9BYW2 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SETD2Q9BYW2 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SETD2Q9BYW2 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SETD2Q9BYW2 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SETD2Q9BYW2 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SETD2Q9BYW2 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SETD2Q9BYW2 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SETD2Q9BYW2 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SETD2Q9BYW2 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SETD2Q9BYW2 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SETD2Q9BYW2 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SETD2Q9BYW2 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SETD2Q9BYW2 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
SETD2Q9BYW2 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SETD2Q9BYW2 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SETD2Q9BYW2 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SETD2Q9BYW2 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SETD2Q9BYW2 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SETD2Q9BYW2 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SETD2Q9BYW2 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SETD2Q9BYW2 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SETD2Q9BYW2 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SETD2Q9BYW2 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SETD2Q9BYW2 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.67
SETD2Q9BYW2 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
SETD2Q9BYW2 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
SETD2Q9BYW2 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
SETD2Q9BYW2 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SETD2Q9BYW2 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SETD2Q9BYW2 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SETD2Q9BYW2 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SETD2Q9BYW2 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SETD2Q9BYW2 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SETD2Q9BYW2 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SETD2Q9BYW2 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SETD2Q9BYW2 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
SETD2Q9BYW2 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SETD2Q9BYW2 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SETD2Q9BYW2 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
SETD2Q9BYW2 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SETD2Q9BYW2 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SETD2Q9BYW2 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SETD2Q9BYW2 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SETD2Q9BYW2 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SETD2Q9BYW2 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SETD2Q9BYW2 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SETD2Q9BYW2 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SETD2Q9BYW2 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SETD2Q9BYW2 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SETD2Q9BYW2 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SETD2Q9BYW2 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SETD2Q9BYW2 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SETD2Q9BYW2 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SETD2Q9BYW2 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SETD2Q9BYW2 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SETD2Q9BYW2 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SETD2Q9BYW2 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SETD2Q9BYW2 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SETD2Q9BYW2 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SETD2Q9BYW2 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SETD2Q9BYW2 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SETD2Q9BYW2 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SETD2Q9BYW2 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
SETD2Q9BYW2 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SETD2Q9BYW2 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SETD2Q9BYW2 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
SETD2Q9BYW2 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
SETD2Q9BYW2 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
SETD2Q9BYW2 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SETD2Q9BYW2 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SETD2Q9BYW2 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SETD2Q9BYW2 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SETD2Q9BYW2 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
SETD2Q9BYW2 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SETD2Q9BYW2 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SETD2Q9BYW2 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SETD2Q9BYW2 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
SETD2Q9BYW2 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SETD2Q9BYW2 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SETD2Q9BYW2 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SETD2Q9BYW2 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SETD2Q9BYW2 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SETD2Q9BYW2 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SETD2Q9BYW2 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.3 ms