Protein–RNA interactions for Protein: Q99570

PIK3R4, Phosphoinositide 3-kinase regulatory subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3R4Q99570 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
PIK3R4Q99570 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC33.21■■■□□ 2.91
PIK3R4Q99570 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC33.21■■■□□ 2.91
PIK3R4Q99570 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC33.21■■■□□ 2.91
PIK3R4Q99570 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC33.2■■■□□ 2.91
PIK3R4Q99570 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
PIK3R4Q99570 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.9
PIK3R4Q99570 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
PIK3R4Q99570 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
PIK3R4Q99570 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC33.19■■■□□ 2.9
PIK3R4Q99570 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
PIK3R4Q99570 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
PIK3R4Q99570 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
PIK3R4Q99570 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
PIK3R4Q99570 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
PIK3R4Q99570 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
PIK3R4Q99570 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC33.17■■■□□ 2.9
PIK3R4Q99570 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC33.17■■■□□ 2.9
PIK3R4Q99570 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
PIK3R4Q99570 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
PIK3R4Q99570 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
PIK3R4Q99570 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC33.15■■■□□ 2.9
PIK3R4Q99570 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
PIK3R4Q99570 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.15■■■□□ 2.9
PIK3R4Q99570 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.15■■■□□ 2.9
PIK3R4Q99570 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
PIK3R4Q99570 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
PIK3R4Q99570 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
PIK3R4Q99570 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.15■■■□□ 2.9
PIK3R4Q99570 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
PIK3R4Q99570 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC33.14■■■□□ 2.9
PIK3R4Q99570 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
PIK3R4Q99570 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.9
PIK3R4Q99570 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC33.13■■■□□ 2.89
PIK3R4Q99570 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
PIK3R4Q99570 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.13■■■□□ 2.89
PIK3R4Q99570 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
PIK3R4Q99570 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
PIK3R4Q99570 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
PIK3R4Q99570 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
PIK3R4Q99570 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
PIK3R4Q99570 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
PIK3R4Q99570 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC33.12■■■□□ 2.89
PIK3R4Q99570 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC33.12■■■□□ 2.89
PIK3R4Q99570 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
PIK3R4Q99570 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.11■■■□□ 2.89
PIK3R4Q99570 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
PIK3R4Q99570 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC33.11■■■□□ 2.89
PIK3R4Q99570 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC33.11■■■□□ 2.89
PIK3R4Q99570 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC33.11■■■□□ 2.89
PIK3R4Q99570 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC33.11■■■□□ 2.89
PIK3R4Q99570 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
PIK3R4Q99570 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
PIK3R4Q99570 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
PIK3R4Q99570 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC33.1■■■□□ 2.89
PIK3R4Q99570 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC33.1■■■□□ 2.89
PIK3R4Q99570 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
PIK3R4Q99570 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
PIK3R4Q99570 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
PIK3R4Q99570 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
PIK3R4Q99570 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
PIK3R4Q99570 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC33.09■■■□□ 2.89
PIK3R4Q99570 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.09■■■□□ 2.89
PIK3R4Q99570 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC33.09■■■□□ 2.89
PIK3R4Q99570 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC33.09■■■□□ 2.89
PIK3R4Q99570 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC33.09■■■□□ 2.89
PIK3R4Q99570 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
PIK3R4Q99570 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
PIK3R4Q99570 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.09■■■□□ 2.89
PIK3R4Q99570 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC33.09■■■□□ 2.89
PIK3R4Q99570 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
PIK3R4Q99570 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
PIK3R4Q99570 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
PIK3R4Q99570 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
PIK3R4Q99570 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
PIK3R4Q99570 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
PIK3R4Q99570 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC33.08■■■□□ 2.89
PIK3R4Q99570 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
PIK3R4Q99570 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC33.07■■■□□ 2.88
PIK3R4Q99570 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC33.07■■■□□ 2.88
PIK3R4Q99570 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC33.07■■■□□ 2.88
PIK3R4Q99570 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC33.06■■■□□ 2.88
PIK3R4Q99570 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC33.06■■■□□ 2.88
PIK3R4Q99570 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC33.06■■■□□ 2.88
PIK3R4Q99570 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
PIK3R4Q99570 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
PIK3R4Q99570 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
PIK3R4Q99570 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC33.06■■■□□ 2.88
PIK3R4Q99570 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
PIK3R4Q99570 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC33.06■■■□□ 2.88
PIK3R4Q99570 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
PIK3R4Q99570 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
PIK3R4Q99570 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC33.05■■■□□ 2.88
PIK3R4Q99570 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.05■■■□□ 2.88
PIK3R4Q99570 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC33.04■■■□□ 2.88
PIK3R4Q99570 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
PIK3R4Q99570 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
PIK3R4Q99570 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
PIK3R4Q99570 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
PIK3R4Q99570 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms