Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q04

LMTK3, Serine/threonine-protein kinase LMTK3, humanhuman

Predictions only

Length 1,460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMTK3Q96Q04 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
LMTK3Q96Q04 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.4■■■■□ 3.1
LMTK3Q96Q04 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
LMTK3Q96Q04 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC34.39■■■■□ 3.1
LMTK3Q96Q04 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC34.39■■■■□ 3.1
LMTK3Q96Q04 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.39■■■■□ 3.1
LMTK3Q96Q04 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
LMTK3Q96Q04 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC34.39■■■■□ 3.1
LMTK3Q96Q04 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC34.39■■■■□ 3.1
LMTK3Q96Q04 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC34.39■■■■□ 3.1
LMTK3Q96Q04 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC34.39■■■■□ 3.1
LMTK3Q96Q04 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC34.39■■■■□ 3.1
LMTK3Q96Q04 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC34.38■■■■□ 3.09
LMTK3Q96Q04 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.38■■■■□ 3.09
LMTK3Q96Q04 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
LMTK3Q96Q04 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
LMTK3Q96Q04 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
LMTK3Q96Q04 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC34.38■■■■□ 3.09
LMTK3Q96Q04 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC34.38■■■■□ 3.09
LMTK3Q96Q04 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC34.38■■■■□ 3.09
LMTK3Q96Q04 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.37■■■■□ 3.09
LMTK3Q96Q04 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
LMTK3Q96Q04 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
LMTK3Q96Q04 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC34.37■■■■□ 3.09
LMTK3Q96Q04 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
LMTK3Q96Q04 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.36■■■■□ 3.09
LMTK3Q96Q04 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC34.36■■■■□ 3.09
LMTK3Q96Q04 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
LMTK3Q96Q04 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC34.35■■■■□ 3.09
LMTK3Q96Q04 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
LMTK3Q96Q04 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
LMTK3Q96Q04 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
LMTK3Q96Q04 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
LMTK3Q96Q04 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC34.33■■■■□ 3.09
LMTK3Q96Q04 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC34.33■■■■□ 3.09
LMTK3Q96Q04 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC34.33■■■■□ 3.09
LMTK3Q96Q04 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.33■■■■□ 3.09
LMTK3Q96Q04 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC34.33■■■■□ 3.09
LMTK3Q96Q04 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
LMTK3Q96Q04 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC34.32■■■■□ 3.08
LMTK3Q96Q04 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC34.32■■■■□ 3.08
LMTK3Q96Q04 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
LMTK3Q96Q04 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC34.32■■■■□ 3.08
LMTK3Q96Q04 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
LMTK3Q96Q04 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC34.31■■■■□ 3.08
LMTK3Q96Q04 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC34.3■■■■□ 3.08
LMTK3Q96Q04 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC34.3■■■■□ 3.08
LMTK3Q96Q04 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC34.3■■■■□ 3.08
LMTK3Q96Q04 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
LMTK3Q96Q04 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
LMTK3Q96Q04 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
LMTK3Q96Q04 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC34.3■■■■□ 3.08
LMTK3Q96Q04 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.3■■■■□ 3.08
LMTK3Q96Q04 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
LMTK3Q96Q04 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC34.29■■■■□ 3.08
LMTK3Q96Q04 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.29■■■■□ 3.08
LMTK3Q96Q04 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
LMTK3Q96Q04 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
LMTK3Q96Q04 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC34.29■■■■□ 3.08
LMTK3Q96Q04 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
LMTK3Q96Q04 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.29■■■■□ 3.08
LMTK3Q96Q04 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC34.29■■■■□ 3.08
LMTK3Q96Q04 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
LMTK3Q96Q04 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
LMTK3Q96Q04 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC34.28■■■■□ 3.08
LMTK3Q96Q04 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.28■■■■□ 3.08
LMTK3Q96Q04 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC34.28■■■■□ 3.08
LMTK3Q96Q04 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC34.28■■■■□ 3.08
LMTK3Q96Q04 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
LMTK3Q96Q04 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
LMTK3Q96Q04 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
LMTK3Q96Q04 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
LMTK3Q96Q04 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
LMTK3Q96Q04 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
LMTK3Q96Q04 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC34.27■■■■□ 3.08
LMTK3Q96Q04 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC34.27■■■■□ 3.08
LMTK3Q96Q04 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
LMTK3Q96Q04 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
LMTK3Q96Q04 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
LMTK3Q96Q04 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC34.26■■■■□ 3.08
LMTK3Q96Q04 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC34.26■■■■□ 3.07
LMTK3Q96Q04 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC34.26■■■■□ 3.07
LMTK3Q96Q04 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC34.26■■■■□ 3.07
LMTK3Q96Q04 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
LMTK3Q96Q04 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC34.25■■■■□ 3.07
LMTK3Q96Q04 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC34.25■■■■□ 3.07
LMTK3Q96Q04 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.25■■■■□ 3.07
LMTK3Q96Q04 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC34.24■■■■□ 3.07
LMTK3Q96Q04 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.24■■■■□ 3.07
LMTK3Q96Q04 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
LMTK3Q96Q04 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC34.23■■■■□ 3.07
LMTK3Q96Q04 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC34.22■■■■□ 3.07
LMTK3Q96Q04 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC34.22■■■■□ 3.07
LMTK3Q96Q04 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC34.22■■■■□ 3.07
LMTK3Q96Q04 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
LMTK3Q96Q04 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.22■■■■□ 3.07
LMTK3Q96Q04 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC34.21■■■■□ 3.07
LMTK3Q96Q04 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC34.21■■■■□ 3.07
LMTK3Q96Q04 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
LMTK3Q96Q04 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.8 ms