Protein–RNA interactions for Protein: Q96MC4

CEP295NL, CEP295 N-terminal-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP295NLQ96MC4 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CEP295NLQ96MC4 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CEP295NLQ96MC4 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CEP295NLQ96MC4 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CEP295NLQ96MC4 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CEP295NLQ96MC4 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CEP295NLQ96MC4 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CEP295NLQ96MC4 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CEP295NLQ96MC4 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CEP295NLQ96MC4 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CEP295NLQ96MC4 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CEP295NLQ96MC4 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CEP295NLQ96MC4 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CEP295NLQ96MC4 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CEP295NLQ96MC4 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CEP295NLQ96MC4 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CEP295NLQ96MC4 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CEP295NLQ96MC4 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CEP295NLQ96MC4 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CEP295NLQ96MC4 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CEP295NLQ96MC4 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CEP295NLQ96MC4 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CEP295NLQ96MC4 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CEP295NLQ96MC4 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CEP295NLQ96MC4 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CEP295NLQ96MC4 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CEP295NLQ96MC4 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CEP295NLQ96MC4 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CEP295NLQ96MC4 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CEP295NLQ96MC4 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CEP295NLQ96MC4 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CEP295NLQ96MC4 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CEP295NLQ96MC4 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CEP295NLQ96MC4 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CEP295NLQ96MC4 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CEP295NLQ96MC4 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CEP295NLQ96MC4 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CEP295NLQ96MC4 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CEP295NLQ96MC4 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CEP295NLQ96MC4 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CEP295NLQ96MC4 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CEP295NLQ96MC4 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CEP295NLQ96MC4 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CEP295NLQ96MC4 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CEP295NLQ96MC4 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CEP295NLQ96MC4 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CEP295NLQ96MC4 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CEP295NLQ96MC4 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CEP295NLQ96MC4 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CEP295NLQ96MC4 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CEP295NLQ96MC4 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CEP295NLQ96MC4 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CEP295NLQ96MC4 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CEP295NLQ96MC4 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CEP295NLQ96MC4 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CEP295NLQ96MC4 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CEP295NLQ96MC4 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CEP295NLQ96MC4 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CEP295NLQ96MC4 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CEP295NLQ96MC4 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CEP295NLQ96MC4 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CEP295NLQ96MC4 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CEP295NLQ96MC4 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CEP295NLQ96MC4 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CEP295NLQ96MC4 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CEP295NLQ96MC4 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CEP295NLQ96MC4 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CEP295NLQ96MC4 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CEP295NLQ96MC4 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CEP295NLQ96MC4 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CEP295NLQ96MC4 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CEP295NLQ96MC4 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CEP295NLQ96MC4 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CEP295NLQ96MC4 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CEP295NLQ96MC4 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CEP295NLQ96MC4 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CEP295NLQ96MC4 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CEP295NLQ96MC4 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CEP295NLQ96MC4 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CEP295NLQ96MC4 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CEP295NLQ96MC4 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CEP295NLQ96MC4 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CEP295NLQ96MC4 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CEP295NLQ96MC4 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CEP295NLQ96MC4 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CEP295NLQ96MC4 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CEP295NLQ96MC4 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CEP295NLQ96MC4 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CEP295NLQ96MC4 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CEP295NLQ96MC4 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CEP295NLQ96MC4 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CEP295NLQ96MC4 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CEP295NLQ96MC4 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CEP295NLQ96MC4 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CEP295NLQ96MC4 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CEP295NLQ96MC4 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CEP295NLQ96MC4 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CEP295NLQ96MC4 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CEP295NLQ96MC4 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
CEP295NLQ96MC4 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.6 ms