Protein–RNA interactions for Protein: Q96FC9

DDX11, ATP-dependent DNA helicase DDX11, humanhuman

Predictions only

Length 970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX11Q96FC9 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
DDX11Q96FC9 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
DDX11Q96FC9 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
DDX11Q96FC9 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
DDX11Q96FC9 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
DDX11Q96FC9 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
DDX11Q96FC9 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
DDX11Q96FC9 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
DDX11Q96FC9 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
DDX11Q96FC9 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
DDX11Q96FC9 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
DDX11Q96FC9 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
DDX11Q96FC9 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
DDX11Q96FC9 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
DDX11Q96FC9 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
DDX11Q96FC9 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
DDX11Q96FC9 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
DDX11Q96FC9 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
DDX11Q96FC9 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
DDX11Q96FC9 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
DDX11Q96FC9 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
DDX11Q96FC9 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
DDX11Q96FC9 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
DDX11Q96FC9 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
DDX11Q96FC9 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
DDX11Q96FC9 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
DDX11Q96FC9 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
DDX11Q96FC9 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
DDX11Q96FC9 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
DDX11Q96FC9 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
DDX11Q96FC9 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
DDX11Q96FC9 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
DDX11Q96FC9 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
DDX11Q96FC9 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
DDX11Q96FC9 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
DDX11Q96FC9 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
DDX11Q96FC9 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
DDX11Q96FC9 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
DDX11Q96FC9 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
DDX11Q96FC9 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
DDX11Q96FC9 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
DDX11Q96FC9 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
DDX11Q96FC9 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
DDX11Q96FC9 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
DDX11Q96FC9 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
DDX11Q96FC9 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
DDX11Q96FC9 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
DDX11Q96FC9 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
DDX11Q96FC9 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
DDX11Q96FC9 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
DDX11Q96FC9 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
DDX11Q96FC9 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
DDX11Q96FC9 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
DDX11Q96FC9 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
DDX11Q96FC9 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC27.57■■■□□ 2
DDX11Q96FC9 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC27.57■■■□□ 2
DDX11Q96FC9 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
DDX11Q96FC9 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
DDX11Q96FC9 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
DDX11Q96FC9 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
DDX11Q96FC9 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
DDX11Q96FC9 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC27.56■■■□□ 2
DDX11Q96FC9 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
DDX11Q96FC9 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
DDX11Q96FC9 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
DDX11Q96FC9 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
DDX11Q96FC9 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
DDX11Q96FC9 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
DDX11Q96FC9 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
DDX11Q96FC9 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
DDX11Q96FC9 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
DDX11Q96FC9 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
DDX11Q96FC9 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
DDX11Q96FC9 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
DDX11Q96FC9 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
DDX11Q96FC9 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
DDX11Q96FC9 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
DDX11Q96FC9 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
DDX11Q96FC9 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
DDX11Q96FC9 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
DDX11Q96FC9 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
DDX11Q96FC9 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
DDX11Q96FC9 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
DDX11Q96FC9 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
DDX11Q96FC9 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
DDX11Q96FC9 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
DDX11Q96FC9 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
DDX11Q96FC9 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
DDX11Q96FC9 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
DDX11Q96FC9 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
DDX11Q96FC9 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
DDX11Q96FC9 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
DDX11Q96FC9 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
DDX11Q96FC9 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
DDX11Q96FC9 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
DDX11Q96FC9 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
DDX11Q96FC9 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
DDX11Q96FC9 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
DDX11Q96FC9 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
DDX11Q96FC9 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms