Protein–RNA interactions for Protein: Q969X6

UTP4, U3 small nucleolar RNA-associated protein 4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 686 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP4Q969X6 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
UTP4Q969X6 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
UTP4Q969X6 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
UTP4Q969X6 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
UTP4Q969X6 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
UTP4Q969X6 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
UTP4Q969X6 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
UTP4Q969X6 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
UTP4Q969X6 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
UTP4Q969X6 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
UTP4Q969X6 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
UTP4Q969X6 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
UTP4Q969X6 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
UTP4Q969X6 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
UTP4Q969X6 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
UTP4Q969X6 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
UTP4Q969X6 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
UTP4Q969X6 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
UTP4Q969X6 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
UTP4Q969X6 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
UTP4Q969X6 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
UTP4Q969X6 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
UTP4Q969X6 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
UTP4Q969X6 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
UTP4Q969X6 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
UTP4Q969X6 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
UTP4Q969X6 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
UTP4Q969X6 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
UTP4Q969X6 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
UTP4Q969X6 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
UTP4Q969X6 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
UTP4Q969X6 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
UTP4Q969X6 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
UTP4Q969X6 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
UTP4Q969X6 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
UTP4Q969X6 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
UTP4Q969X6 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
UTP4Q969X6 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
UTP4Q969X6 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
UTP4Q969X6 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
UTP4Q969X6 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
UTP4Q969X6 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
UTP4Q969X6 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
UTP4Q969X6 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
UTP4Q969X6 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
UTP4Q969X6 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
UTP4Q969X6 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
UTP4Q969X6 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
UTP4Q969X6 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
UTP4Q969X6 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
UTP4Q969X6 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
UTP4Q969X6 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
UTP4Q969X6 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
UTP4Q969X6 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
UTP4Q969X6 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
UTP4Q969X6 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
UTP4Q969X6 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
UTP4Q969X6 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
UTP4Q969X6 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
UTP4Q969X6 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
UTP4Q969X6 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
UTP4Q969X6 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
UTP4Q969X6 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
UTP4Q969X6 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
UTP4Q969X6 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
UTP4Q969X6 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
UTP4Q969X6 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
UTP4Q969X6 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
UTP4Q969X6 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
UTP4Q969X6 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
UTP4Q969X6 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
UTP4Q969X6 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
UTP4Q969X6 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
UTP4Q969X6 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
UTP4Q969X6 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
UTP4Q969X6 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
UTP4Q969X6 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
UTP4Q969X6 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
UTP4Q969X6 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
UTP4Q969X6 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
UTP4Q969X6 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
UTP4Q969X6 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
UTP4Q969X6 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
UTP4Q969X6 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
UTP4Q969X6 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
UTP4Q969X6 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
UTP4Q969X6 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
UTP4Q969X6 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
UTP4Q969X6 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
UTP4Q969X6 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
UTP4Q969X6 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
UTP4Q969X6 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
UTP4Q969X6 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
UTP4Q969X6 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
UTP4Q969X6 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
UTP4Q969X6 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
UTP4Q969X6 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
UTP4Q969X6 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
UTP4Q969X6 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
UTP4Q969X6 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms