Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEW7

TMIE, Transmembrane inner ear expressed protein, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIEQ8NEW7 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TMIEQ8NEW7 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TMIEQ8NEW7 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TMIEQ8NEW7 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TMIEQ8NEW7 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TMIEQ8NEW7 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TMIEQ8NEW7 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TMIEQ8NEW7 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TMIEQ8NEW7 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TMIEQ8NEW7 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TMIEQ8NEW7 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TMIEQ8NEW7 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TMIEQ8NEW7 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TMIEQ8NEW7 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TMIEQ8NEW7 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
TMIEQ8NEW7 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TMIEQ8NEW7 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TMIEQ8NEW7 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TMIEQ8NEW7 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TMIEQ8NEW7 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TMIEQ8NEW7 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TMIEQ8NEW7 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TMIEQ8NEW7 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TMIEQ8NEW7 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
TMIEQ8NEW7 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TMIEQ8NEW7 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TMIEQ8NEW7 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMIEQ8NEW7 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMIEQ8NEW7 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMIEQ8NEW7 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMIEQ8NEW7 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMIEQ8NEW7 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMIEQ8NEW7 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMIEQ8NEW7 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMIEQ8NEW7 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMIEQ8NEW7 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMIEQ8NEW7 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMIEQ8NEW7 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMIEQ8NEW7 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
TMIEQ8NEW7 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMIEQ8NEW7 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMIEQ8NEW7 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMIEQ8NEW7 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMIEQ8NEW7 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMIEQ8NEW7 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
TMIEQ8NEW7 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
TMIEQ8NEW7 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.35
TMIEQ8NEW7 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMIEQ8NEW7 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMIEQ8NEW7 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMIEQ8NEW7 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMIEQ8NEW7 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMIEQ8NEW7 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMIEQ8NEW7 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMIEQ8NEW7 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMIEQ8NEW7 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMIEQ8NEW7 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMIEQ8NEW7 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMIEQ8NEW7 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMIEQ8NEW7 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMIEQ8NEW7 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
TMIEQ8NEW7 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
TMIEQ8NEW7 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
TMIEQ8NEW7 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
TMIEQ8NEW7 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
TMIEQ8NEW7 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMIEQ8NEW7 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMIEQ8NEW7 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMIEQ8NEW7 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMIEQ8NEW7 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMIEQ8NEW7 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMIEQ8NEW7 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMIEQ8NEW7 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMIEQ8NEW7 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMIEQ8NEW7 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMIEQ8NEW7 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMIEQ8NEW7 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMIEQ8NEW7 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMIEQ8NEW7 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMIEQ8NEW7 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMIEQ8NEW7 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMIEQ8NEW7 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMIEQ8NEW7 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMIEQ8NEW7 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMIEQ8NEW7 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMIEQ8NEW7 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMIEQ8NEW7 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TMIEQ8NEW7 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TMIEQ8NEW7 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TMIEQ8NEW7 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
TMIEQ8NEW7 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TMIEQ8NEW7 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TMIEQ8NEW7 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TMIEQ8NEW7 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TMIEQ8NEW7 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TMIEQ8NEW7 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMIEQ8NEW7 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMIEQ8NEW7 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMIEQ8NEW7 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMIEQ8NEW7 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.4 ms