Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z2E3

APTX, Aprataxin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APTXQ7Z2E3 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
APTXQ7Z2E3 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
APTXQ7Z2E3 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
APTXQ7Z2E3 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
APTXQ7Z2E3 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
APTXQ7Z2E3 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
APTXQ7Z2E3 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
APTXQ7Z2E3 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
APTXQ7Z2E3 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
APTXQ7Z2E3 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
APTXQ7Z2E3 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
APTXQ7Z2E3 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
APTXQ7Z2E3 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
APTXQ7Z2E3 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
APTXQ7Z2E3 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
APTXQ7Z2E3 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
APTXQ7Z2E3 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
APTXQ7Z2E3 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
APTXQ7Z2E3 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
APTXQ7Z2E3 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
APTXQ7Z2E3 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
APTXQ7Z2E3 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
APTXQ7Z2E3 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
APTXQ7Z2E3 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
APTXQ7Z2E3 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
APTXQ7Z2E3 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
APTXQ7Z2E3 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
APTXQ7Z2E3 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
APTXQ7Z2E3 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
APTXQ7Z2E3 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
APTXQ7Z2E3 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
APTXQ7Z2E3 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
APTXQ7Z2E3 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
APTXQ7Z2E3 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
APTXQ7Z2E3 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
APTXQ7Z2E3 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
APTXQ7Z2E3 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
APTXQ7Z2E3 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
APTXQ7Z2E3 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
APTXQ7Z2E3 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
APTXQ7Z2E3 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
APTXQ7Z2E3 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
APTXQ7Z2E3 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
APTXQ7Z2E3 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
APTXQ7Z2E3 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
APTXQ7Z2E3 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
APTXQ7Z2E3 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
APTXQ7Z2E3 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
APTXQ7Z2E3 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
APTXQ7Z2E3 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
APTXQ7Z2E3 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
APTXQ7Z2E3 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
APTXQ7Z2E3 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
APTXQ7Z2E3 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
APTXQ7Z2E3 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
APTXQ7Z2E3 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
APTXQ7Z2E3 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
APTXQ7Z2E3 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
APTXQ7Z2E3 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
APTXQ7Z2E3 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
APTXQ7Z2E3 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
APTXQ7Z2E3 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
APTXQ7Z2E3 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
APTXQ7Z2E3 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
APTXQ7Z2E3 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
APTXQ7Z2E3 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
APTXQ7Z2E3 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
APTXQ7Z2E3 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
APTXQ7Z2E3 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
APTXQ7Z2E3 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
APTXQ7Z2E3 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
APTXQ7Z2E3 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
APTXQ7Z2E3 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
APTXQ7Z2E3 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
APTXQ7Z2E3 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
APTXQ7Z2E3 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
APTXQ7Z2E3 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
APTXQ7Z2E3 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
APTXQ7Z2E3 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
APTXQ7Z2E3 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
APTXQ7Z2E3 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
APTXQ7Z2E3 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
APTXQ7Z2E3 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
APTXQ7Z2E3 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
APTXQ7Z2E3 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
APTXQ7Z2E3 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
APTXQ7Z2E3 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
APTXQ7Z2E3 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
APTXQ7Z2E3 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
APTXQ7Z2E3 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
APTXQ7Z2E3 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
APTXQ7Z2E3 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
APTXQ7Z2E3 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
APTXQ7Z2E3 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
APTXQ7Z2E3 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
APTXQ7Z2E3 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
APTXQ7Z2E3 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
APTXQ7Z2E3 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
APTXQ7Z2E3 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
APTXQ7Z2E3 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms