Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZTI6

RFLNA, Refilin-A, humanhuman

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFLNAQ6ZTI6 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RFLNAQ6ZTI6 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RFLNAQ6ZTI6 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RFLNAQ6ZTI6 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RFLNAQ6ZTI6 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RFLNAQ6ZTI6 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
RFLNAQ6ZTI6 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
RFLNAQ6ZTI6 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
RFLNAQ6ZTI6 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RFLNAQ6ZTI6 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RFLNAQ6ZTI6 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RFLNAQ6ZTI6 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RFLNAQ6ZTI6 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RFLNAQ6ZTI6 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RFLNAQ6ZTI6 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RFLNAQ6ZTI6 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RFLNAQ6ZTI6 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RFLNAQ6ZTI6 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RFLNAQ6ZTI6 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RFLNAQ6ZTI6 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RFLNAQ6ZTI6 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RFLNAQ6ZTI6 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RFLNAQ6ZTI6 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RFLNAQ6ZTI6 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RFLNAQ6ZTI6 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
RFLNAQ6ZTI6 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RFLNAQ6ZTI6 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RFLNAQ6ZTI6 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RFLNAQ6ZTI6 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RFLNAQ6ZTI6 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RFLNAQ6ZTI6 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
RFLNAQ6ZTI6 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RFLNAQ6ZTI6 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RFLNAQ6ZTI6 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RFLNAQ6ZTI6 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RFLNAQ6ZTI6 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RFLNAQ6ZTI6 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
RFLNAQ6ZTI6 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
RFLNAQ6ZTI6 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RFLNAQ6ZTI6 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RFLNAQ6ZTI6 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RFLNAQ6ZTI6 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RFLNAQ6ZTI6 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RFLNAQ6ZTI6 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RFLNAQ6ZTI6 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RFLNAQ6ZTI6 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RFLNAQ6ZTI6 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RFLNAQ6ZTI6 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RFLNAQ6ZTI6 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
RFLNAQ6ZTI6 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RFLNAQ6ZTI6 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
RFLNAQ6ZTI6 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RFLNAQ6ZTI6 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RFLNAQ6ZTI6 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RFLNAQ6ZTI6 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RFLNAQ6ZTI6 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RFLNAQ6ZTI6 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RFLNAQ6ZTI6 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RFLNAQ6ZTI6 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RFLNAQ6ZTI6 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RFLNAQ6ZTI6 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RFLNAQ6ZTI6 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RFLNAQ6ZTI6 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RFLNAQ6ZTI6 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RFLNAQ6ZTI6 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RFLNAQ6ZTI6 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RFLNAQ6ZTI6 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RFLNAQ6ZTI6 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RFLNAQ6ZTI6 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RFLNAQ6ZTI6 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RFLNAQ6ZTI6 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RFLNAQ6ZTI6 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RFLNAQ6ZTI6 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RFLNAQ6ZTI6 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RFLNAQ6ZTI6 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
RFLNAQ6ZTI6 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RFLNAQ6ZTI6 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RFLNAQ6ZTI6 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RFLNAQ6ZTI6 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RFLNAQ6ZTI6 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RFLNAQ6ZTI6 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
RFLNAQ6ZTI6 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RFLNAQ6ZTI6 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RFLNAQ6ZTI6 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RFLNAQ6ZTI6 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RFLNAQ6ZTI6 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RFLNAQ6ZTI6 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RFLNAQ6ZTI6 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RFLNAQ6ZTI6 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RFLNAQ6ZTI6 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
RFLNAQ6ZTI6 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
RFLNAQ6ZTI6 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RFLNAQ6ZTI6 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RFLNAQ6ZTI6 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
RFLNAQ6ZTI6 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RFLNAQ6ZTI6 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RFLNAQ6ZTI6 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
RFLNAQ6ZTI6 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RFLNAQ6ZTI6 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
RFLNAQ6ZTI6 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57 ms