Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSA7

LRRC55, Leucine-rich repeat-containing protein 55, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC55Q6ZSA7 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
LRRC55Q6ZSA7 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LRRC55Q6ZSA7 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LRRC55Q6ZSA7 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LRRC55Q6ZSA7 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
LRRC55Q6ZSA7 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
LRRC55Q6ZSA7 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LRRC55Q6ZSA7 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
LRRC55Q6ZSA7 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LRRC55Q6ZSA7 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LRRC55Q6ZSA7 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
LRRC55Q6ZSA7 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
LRRC55Q6ZSA7 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
LRRC55Q6ZSA7 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
LRRC55Q6ZSA7 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
LRRC55Q6ZSA7 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
LRRC55Q6ZSA7 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
LRRC55Q6ZSA7 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
LRRC55Q6ZSA7 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LRRC55Q6ZSA7 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LRRC55Q6ZSA7 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
LRRC55Q6ZSA7 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
LRRC55Q6ZSA7 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
LRRC55Q6ZSA7 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
LRRC55Q6ZSA7 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
LRRC55Q6ZSA7 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
LRRC55Q6ZSA7 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
LRRC55Q6ZSA7 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
LRRC55Q6ZSA7 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
LRRC55Q6ZSA7 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
LRRC55Q6ZSA7 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
LRRC55Q6ZSA7 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
LRRC55Q6ZSA7 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
LRRC55Q6ZSA7 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
LRRC55Q6ZSA7 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
LRRC55Q6ZSA7 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
LRRC55Q6ZSA7 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
LRRC55Q6ZSA7 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
LRRC55Q6ZSA7 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
LRRC55Q6ZSA7 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
LRRC55Q6ZSA7 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
LRRC55Q6ZSA7 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
LRRC55Q6ZSA7 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
LRRC55Q6ZSA7 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
LRRC55Q6ZSA7 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
LRRC55Q6ZSA7 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
LRRC55Q6ZSA7 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
LRRC55Q6ZSA7 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
LRRC55Q6ZSA7 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
LRRC55Q6ZSA7 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
LRRC55Q6ZSA7 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
LRRC55Q6ZSA7 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
LRRC55Q6ZSA7 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
LRRC55Q6ZSA7 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
LRRC55Q6ZSA7 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
LRRC55Q6ZSA7 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
LRRC55Q6ZSA7 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
LRRC55Q6ZSA7 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
LRRC55Q6ZSA7 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
LRRC55Q6ZSA7 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
LRRC55Q6ZSA7 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
LRRC55Q6ZSA7 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
LRRC55Q6ZSA7 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
LRRC55Q6ZSA7 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
LRRC55Q6ZSA7 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
LRRC55Q6ZSA7 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
LRRC55Q6ZSA7 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
LRRC55Q6ZSA7 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
LRRC55Q6ZSA7 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
LRRC55Q6ZSA7 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
LRRC55Q6ZSA7 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
LRRC55Q6ZSA7 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
LRRC55Q6ZSA7 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
LRRC55Q6ZSA7 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
LRRC55Q6ZSA7 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
LRRC55Q6ZSA7 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
LRRC55Q6ZSA7 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
LRRC55Q6ZSA7 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
LRRC55Q6ZSA7 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
LRRC55Q6ZSA7 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
LRRC55Q6ZSA7 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
LRRC55Q6ZSA7 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
LRRC55Q6ZSA7 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LRRC55Q6ZSA7 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LRRC55Q6ZSA7 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LRRC55Q6ZSA7 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
LRRC55Q6ZSA7 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LRRC55Q6ZSA7 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LRRC55Q6ZSA7 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
LRRC55Q6ZSA7 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
LRRC55Q6ZSA7 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LRRC55Q6ZSA7 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LRRC55Q6ZSA7 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
LRRC55Q6ZSA7 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
LRRC55Q6ZSA7 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
LRRC55Q6ZSA7 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
LRRC55Q6ZSA7 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
LRRC55Q6ZSA7 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
LRRC55Q6ZSA7 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
LRRC55Q6ZSA7 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms