Protein–RNA interactions for Protein: Q6X4U4

SOSTDC1, Sclerostin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOSTDC1Q6X4U4 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SOSTDC1Q6X4U4 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SOSTDC1Q6X4U4 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SOSTDC1Q6X4U4 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SOSTDC1Q6X4U4 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SOSTDC1Q6X4U4 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SOSTDC1Q6X4U4 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SOSTDC1Q6X4U4 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SOSTDC1Q6X4U4 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SOSTDC1Q6X4U4 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SOSTDC1Q6X4U4 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SOSTDC1Q6X4U4 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SOSTDC1Q6X4U4 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SOSTDC1Q6X4U4 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SOSTDC1Q6X4U4 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SOSTDC1Q6X4U4 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SOSTDC1Q6X4U4 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SOSTDC1Q6X4U4 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SOSTDC1Q6X4U4 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SOSTDC1Q6X4U4 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SOSTDC1Q6X4U4 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SOSTDC1Q6X4U4 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SOSTDC1Q6X4U4 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SOSTDC1Q6X4U4 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SOSTDC1Q6X4U4 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SOSTDC1Q6X4U4 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SOSTDC1Q6X4U4 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SOSTDC1Q6X4U4 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SOSTDC1Q6X4U4 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SOSTDC1Q6X4U4 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SOSTDC1Q6X4U4 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SOSTDC1Q6X4U4 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SOSTDC1Q6X4U4 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SOSTDC1Q6X4U4 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SOSTDC1Q6X4U4 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SOSTDC1Q6X4U4 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SOSTDC1Q6X4U4 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SOSTDC1Q6X4U4 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SOSTDC1Q6X4U4 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SOSTDC1Q6X4U4 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SOSTDC1Q6X4U4 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SOSTDC1Q6X4U4 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SOSTDC1Q6X4U4 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SOSTDC1Q6X4U4 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SOSTDC1Q6X4U4 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SOSTDC1Q6X4U4 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SOSTDC1Q6X4U4 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SOSTDC1Q6X4U4 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SOSTDC1Q6X4U4 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SOSTDC1Q6X4U4 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SOSTDC1Q6X4U4 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SOSTDC1Q6X4U4 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SOSTDC1Q6X4U4 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SOSTDC1Q6X4U4 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SOSTDC1Q6X4U4 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SOSTDC1Q6X4U4 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SOSTDC1Q6X4U4 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SOSTDC1Q6X4U4 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SOSTDC1Q6X4U4 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SOSTDC1Q6X4U4 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SOSTDC1Q6X4U4 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SOSTDC1Q6X4U4 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SOSTDC1Q6X4U4 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SOSTDC1Q6X4U4 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SOSTDC1Q6X4U4 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SOSTDC1Q6X4U4 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SOSTDC1Q6X4U4 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SOSTDC1Q6X4U4 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SOSTDC1Q6X4U4 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SOSTDC1Q6X4U4 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SOSTDC1Q6X4U4 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SOSTDC1Q6X4U4 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SOSTDC1Q6X4U4 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SOSTDC1Q6X4U4 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SOSTDC1Q6X4U4 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SOSTDC1Q6X4U4 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SOSTDC1Q6X4U4 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SOSTDC1Q6X4U4 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SOSTDC1Q6X4U4 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SOSTDC1Q6X4U4 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SOSTDC1Q6X4U4 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SOSTDC1Q6X4U4 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SOSTDC1Q6X4U4 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SOSTDC1Q6X4U4 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SOSTDC1Q6X4U4 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SOSTDC1Q6X4U4 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SOSTDC1Q6X4U4 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SOSTDC1Q6X4U4 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SOSTDC1Q6X4U4 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SOSTDC1Q6X4U4 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SOSTDC1Q6X4U4 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SOSTDC1Q6X4U4 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SOSTDC1Q6X4U4 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SOSTDC1Q6X4U4 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SOSTDC1Q6X4U4 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SOSTDC1Q6X4U4 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SOSTDC1Q6X4U4 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SOSTDC1Q6X4U4 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SOSTDC1Q6X4U4 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SOSTDC1Q6X4U4 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms