Protein–RNA interactions for Protein: Q5TG30

ARHGAP40, Rho GTPase-activating protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGAP40Q5TG30 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARHGAP40Q5TG30 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARHGAP40Q5TG30 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARHGAP40Q5TG30 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARHGAP40Q5TG30 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARHGAP40Q5TG30 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARHGAP40Q5TG30 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARHGAP40Q5TG30 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARHGAP40Q5TG30 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARHGAP40Q5TG30 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARHGAP40Q5TG30 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARHGAP40Q5TG30 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARHGAP40Q5TG30 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ARHGAP40Q5TG30 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ARHGAP40Q5TG30 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ARHGAP40Q5TG30 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ARHGAP40Q5TG30 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ARHGAP40Q5TG30 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ARHGAP40Q5TG30 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ARHGAP40Q5TG30 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ARHGAP40Q5TG30 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ARHGAP40Q5TG30 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ARHGAP40Q5TG30 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARHGAP40Q5TG30 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARHGAP40Q5TG30 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARHGAP40Q5TG30 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARHGAP40Q5TG30 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARHGAP40Q5TG30 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARHGAP40Q5TG30 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARHGAP40Q5TG30 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARHGAP40Q5TG30 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARHGAP40Q5TG30 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARHGAP40Q5TG30 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARHGAP40Q5TG30 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARHGAP40Q5TG30 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
ARHGAP40Q5TG30 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
ARHGAP40Q5TG30 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARHGAP40Q5TG30 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARHGAP40Q5TG30 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARHGAP40Q5TG30 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARHGAP40Q5TG30 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARHGAP40Q5TG30 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARHGAP40Q5TG30 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARHGAP40Q5TG30 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARHGAP40Q5TG30 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARHGAP40Q5TG30 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARHGAP40Q5TG30 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARHGAP40Q5TG30 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARHGAP40Q5TG30 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARHGAP40Q5TG30 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARHGAP40Q5TG30 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARHGAP40Q5TG30 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARHGAP40Q5TG30 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARHGAP40Q5TG30 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARHGAP40Q5TG30 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARHGAP40Q5TG30 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARHGAP40Q5TG30 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARHGAP40Q5TG30 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARHGAP40Q5TG30 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARHGAP40Q5TG30 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ARHGAP40Q5TG30 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARHGAP40Q5TG30 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARHGAP40Q5TG30 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARHGAP40Q5TG30 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARHGAP40Q5TG30 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARHGAP40Q5TG30 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARHGAP40Q5TG30 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARHGAP40Q5TG30 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ARHGAP40Q5TG30 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ARHGAP40Q5TG30 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ARHGAP40Q5TG30 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARHGAP40Q5TG30 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARHGAP40Q5TG30 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ARHGAP40Q5TG30 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ARHGAP40Q5TG30 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ARHGAP40Q5TG30 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ARHGAP40Q5TG30 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ARHGAP40Q5TG30 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ARHGAP40Q5TG30 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ARHGAP40Q5TG30 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ARHGAP40Q5TG30 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ARHGAP40Q5TG30 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ARHGAP40Q5TG30 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ARHGAP40Q5TG30 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ARHGAP40Q5TG30 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
ARHGAP40Q5TG30 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ARHGAP40Q5TG30 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ARHGAP40Q5TG30 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARHGAP40Q5TG30 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARHGAP40Q5TG30 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARHGAP40Q5TG30 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARHGAP40Q5TG30 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ARHGAP40Q5TG30 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ARHGAP40Q5TG30 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ARHGAP40Q5TG30 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ARHGAP40Q5TG30 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
ARHGAP40Q5TG30 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ARHGAP40Q5TG30 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ARHGAP40Q5TG30 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ARHGAP40Q5TG30 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95 ms