Protein–RNA interactions for Protein: Q5TB30

DEPDC1, DEP domain-containing protein 1A, humanhuman

Predictions only

Length 811 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEPDC1Q5TB30 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DEPDC1Q5TB30 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
DEPDC1Q5TB30 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
DEPDC1Q5TB30 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DEPDC1Q5TB30 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DEPDC1Q5TB30 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DEPDC1Q5TB30 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
DEPDC1Q5TB30 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DEPDC1Q5TB30 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DEPDC1Q5TB30 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
DEPDC1Q5TB30 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
DEPDC1Q5TB30 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DEPDC1Q5TB30 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DEPDC1Q5TB30 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DEPDC1Q5TB30 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DEPDC1Q5TB30 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DEPDC1Q5TB30 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DEPDC1Q5TB30 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DEPDC1Q5TB30 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DEPDC1Q5TB30 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DEPDC1Q5TB30 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DEPDC1Q5TB30 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DEPDC1Q5TB30 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DEPDC1Q5TB30 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DEPDC1Q5TB30 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DEPDC1Q5TB30 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DEPDC1Q5TB30 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DEPDC1Q5TB30 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DEPDC1Q5TB30 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DEPDC1Q5TB30 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DEPDC1Q5TB30 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DEPDC1Q5TB30 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DEPDC1Q5TB30 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DEPDC1Q5TB30 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DEPDC1Q5TB30 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DEPDC1Q5TB30 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DEPDC1Q5TB30 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DEPDC1Q5TB30 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DEPDC1Q5TB30 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DEPDC1Q5TB30 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DEPDC1Q5TB30 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DEPDC1Q5TB30 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DEPDC1Q5TB30 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
DEPDC1Q5TB30 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DEPDC1Q5TB30 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DEPDC1Q5TB30 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DEPDC1Q5TB30 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DEPDC1Q5TB30 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DEPDC1Q5TB30 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DEPDC1Q5TB30 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DEPDC1Q5TB30 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DEPDC1Q5TB30 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DEPDC1Q5TB30 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DEPDC1Q5TB30 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DEPDC1Q5TB30 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DEPDC1Q5TB30 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DEPDC1Q5TB30 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DEPDC1Q5TB30 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DEPDC1Q5TB30 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DEPDC1Q5TB30 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DEPDC1Q5TB30 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
DEPDC1Q5TB30 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DEPDC1Q5TB30 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DEPDC1Q5TB30 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DEPDC1Q5TB30 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
DEPDC1Q5TB30 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
DEPDC1Q5TB30 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DEPDC1Q5TB30 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
DEPDC1Q5TB30 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DEPDC1Q5TB30 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DEPDC1Q5TB30 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DEPDC1Q5TB30 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DEPDC1Q5TB30 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DEPDC1Q5TB30 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DEPDC1Q5TB30 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DEPDC1Q5TB30 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
DEPDC1Q5TB30 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
DEPDC1Q5TB30 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
DEPDC1Q5TB30 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
DEPDC1Q5TB30 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
DEPDC1Q5TB30 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
DEPDC1Q5TB30 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
DEPDC1Q5TB30 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
DEPDC1Q5TB30 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
DEPDC1Q5TB30 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
DEPDC1Q5TB30 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DEPDC1Q5TB30 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DEPDC1Q5TB30 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
DEPDC1Q5TB30 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DEPDC1Q5TB30 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DEPDC1Q5TB30 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DEPDC1Q5TB30 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DEPDC1Q5TB30 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DEPDC1Q5TB30 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DEPDC1Q5TB30 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DEPDC1Q5TB30 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DEPDC1Q5TB30 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DEPDC1Q5TB30 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DEPDC1Q5TB30 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DEPDC1Q5TB30 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.9 ms