Protein–RNA interactions for Protein: Q16637

SMN1, Survival motor neuron protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 294 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMN1Q16637 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
SMN1Q16637 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
SMN1Q16637 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
SMN1Q16637 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
SMN1Q16637 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
SMN1Q16637 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
SMN1Q16637 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
SMN1Q16637 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SMN1Q16637 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SMN1Q16637 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SMN1Q16637 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SMN1Q16637 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
SMN1Q16637 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SMN1Q16637 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SMN1Q16637 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SMN1Q16637 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SMN1Q16637 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SMN1Q16637 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SMN1Q16637 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SMN1Q16637 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SMN1Q16637 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SMN1Q16637 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SMN1Q16637 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SMN1Q16637 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SMN1Q16637 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SMN1Q16637 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SMN1Q16637 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SMN1Q16637 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SMN1Q16637 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SMN1Q16637 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SMN1Q16637 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SMN1Q16637 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SMN1Q16637 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
SMN1Q16637 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SMN1Q16637 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SMN1Q16637 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SMN1Q16637 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SMN1Q16637 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SMN1Q16637 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SMN1Q16637 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SMN1Q16637 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SMN1Q16637 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SMN1Q16637 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SMN1Q16637 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SMN1Q16637 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SMN1Q16637 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SMN1Q16637 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SMN1Q16637 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SMN1Q16637 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SMN1Q16637 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SMN1Q16637 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SMN1Q16637 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SMN1Q16637 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SMN1Q16637 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SMN1Q16637 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SMN1Q16637 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SMN1Q16637 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SMN1Q16637 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SMN1Q16637 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SMN1Q16637 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SMN1Q16637 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SMN1Q16637 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
SMN1Q16637 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SMN1Q16637 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SMN1Q16637 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SMN1Q16637 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SMN1Q16637 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
SMN1Q16637 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SMN1Q16637 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SMN1Q16637 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SMN1Q16637 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
SMN1Q16637 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SMN1Q16637 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SMN1Q16637 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SMN1Q16637 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SMN1Q16637 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SMN1Q16637 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SMN1Q16637 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SMN1Q16637 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SMN1Q16637 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SMN1Q16637 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SMN1Q16637 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SMN1Q16637 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SMN1Q16637 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SMN1Q16637 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SMN1Q16637 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SMN1Q16637 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SMN1Q16637 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SMN1Q16637 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SMN1Q16637 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SMN1Q16637 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SMN1Q16637 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SMN1Q16637 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SMN1Q16637 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SMN1Q16637 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SMN1Q16637 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SMN1Q16637 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SMN1Q16637 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SMN1Q16637 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SMN1Q16637 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
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