Protein–RNA interactions for Protein: Q15293

RCN1, Reticulocalbin-1, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCN1Q15293 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RCN1Q15293 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RCN1Q15293 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RCN1Q15293 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
RCN1Q15293 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RCN1Q15293 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
RCN1Q15293 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RCN1Q15293 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RCN1Q15293 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RCN1Q15293 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RCN1Q15293 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RCN1Q15293 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RCN1Q15293 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RCN1Q15293 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
RCN1Q15293 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RCN1Q15293 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RCN1Q15293 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RCN1Q15293 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
RCN1Q15293 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
RCN1Q15293 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RCN1Q15293 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
RCN1Q15293 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RCN1Q15293 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RCN1Q15293 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RCN1Q15293 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RCN1Q15293 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RCN1Q15293 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RCN1Q15293 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RCN1Q15293 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RCN1Q15293 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RCN1Q15293 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RCN1Q15293 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RCN1Q15293 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RCN1Q15293 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RCN1Q15293 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RCN1Q15293 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RCN1Q15293 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RCN1Q15293 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RCN1Q15293 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RCN1Q15293 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RCN1Q15293 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RCN1Q15293 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RCN1Q15293 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RCN1Q15293 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RCN1Q15293 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
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RCN1Q15293 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RCN1Q15293 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RCN1Q15293 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RCN1Q15293 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RCN1Q15293 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RCN1Q15293 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RCN1Q15293 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RCN1Q15293 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
RCN1Q15293 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RCN1Q15293 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RCN1Q15293 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RCN1Q15293 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RCN1Q15293 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RCN1Q15293 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RCN1Q15293 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RCN1Q15293 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RCN1Q15293 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RCN1Q15293 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RCN1Q15293 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RCN1Q15293 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RCN1Q15293 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RCN1Q15293 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RCN1Q15293 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RCN1Q15293 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RCN1Q15293 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
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RCN1Q15293 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
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RCN1Q15293 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
RCN1Q15293 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RCN1Q15293 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RCN1Q15293 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RCN1Q15293 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RCN1Q15293 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RCN1Q15293 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RCN1Q15293 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RCN1Q15293 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RCN1Q15293 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RCN1Q15293 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
RCN1Q15293 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RCN1Q15293 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RCN1Q15293 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RCN1Q15293 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RCN1Q15293 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RCN1Q15293 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RCN1Q15293 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RCN1Q15293 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RCN1Q15293 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RCN1Q15293 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RCN1Q15293 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RCN1Q15293 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RCN1Q15293 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RCN1Q15293 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RCN1Q15293 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
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