Protein–RNA interactions for Protein: Q13797

ITGA9, Integrin alpha-9, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA9Q13797 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ITGA9Q13797 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ITGA9Q13797 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ITGA9Q13797 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ITGA9Q13797 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ITGA9Q13797 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ITGA9Q13797 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ITGA9Q13797 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ITGA9Q13797 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ITGA9Q13797 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ITGA9Q13797 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ITGA9Q13797 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ITGA9Q13797 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ITGA9Q13797 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ITGA9Q13797 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ITGA9Q13797 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ITGA9Q13797 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ITGA9Q13797 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ITGA9Q13797 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ITGA9Q13797 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ITGA9Q13797 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ITGA9Q13797 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ITGA9Q13797 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ITGA9Q13797 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ITGA9Q13797 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ITGA9Q13797 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ITGA9Q13797 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ITGA9Q13797 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ITGA9Q13797 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ITGA9Q13797 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ITGA9Q13797 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
ITGA9Q13797 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ITGA9Q13797 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ITGA9Q13797 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ITGA9Q13797 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ITGA9Q13797 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ITGA9Q13797 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ITGA9Q13797 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ITGA9Q13797 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ITGA9Q13797 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ITGA9Q13797 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ITGA9Q13797 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ITGA9Q13797 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
ITGA9Q13797 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ITGA9Q13797 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ITGA9Q13797 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ITGA9Q13797 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ITGA9Q13797 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ITGA9Q13797 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ITGA9Q13797 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ITGA9Q13797 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ITGA9Q13797 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ITGA9Q13797 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ITGA9Q13797 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ITGA9Q13797 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ITGA9Q13797 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ITGA9Q13797 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
ITGA9Q13797 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
ITGA9Q13797 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ITGA9Q13797 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ITGA9Q13797 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ITGA9Q13797 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
ITGA9Q13797 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ITGA9Q13797 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ITGA9Q13797 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ITGA9Q13797 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ITGA9Q13797 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ITGA9Q13797 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ITGA9Q13797 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ITGA9Q13797 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ITGA9Q13797 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ITGA9Q13797 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ITGA9Q13797 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ITGA9Q13797 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ITGA9Q13797 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
ITGA9Q13797 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ITGA9Q13797 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ITGA9Q13797 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ITGA9Q13797 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ITGA9Q13797 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ITGA9Q13797 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ITGA9Q13797 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ITGA9Q13797 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ITGA9Q13797 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ITGA9Q13797 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ITGA9Q13797 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ITGA9Q13797 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ITGA9Q13797 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ITGA9Q13797 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ITGA9Q13797 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ITGA9Q13797 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ITGA9Q13797 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ITGA9Q13797 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ITGA9Q13797 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ITGA9Q13797 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ITGA9Q13797 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ITGA9Q13797 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ITGA9Q13797 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ITGA9Q13797 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ITGA9Q13797 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms