Protein–RNA interactions for Protein: Q13546

RIPK1, Receptor-interacting serine/threonine-protein kinase 1, humanhuman

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Length 671 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPK1Q13546 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RIPK1Q13546 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
RIPK1Q13546 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RIPK1Q13546 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
RIPK1Q13546 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
RIPK1Q13546 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RIPK1Q13546 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RIPK1Q13546 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RIPK1Q13546 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RIPK1Q13546 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RIPK1Q13546 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RIPK1Q13546 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RIPK1Q13546 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RIPK1Q13546 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RIPK1Q13546 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RIPK1Q13546 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RIPK1Q13546 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RIPK1Q13546 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RIPK1Q13546 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RIPK1Q13546 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RIPK1Q13546 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RIPK1Q13546 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RIPK1Q13546 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RIPK1Q13546 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RIPK1Q13546 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RIPK1Q13546 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RIPK1Q13546 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RIPK1Q13546 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RIPK1Q13546 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RIPK1Q13546 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RIPK1Q13546 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RIPK1Q13546 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RIPK1Q13546 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RIPK1Q13546 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RIPK1Q13546 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RIPK1Q13546 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RIPK1Q13546 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RIPK1Q13546 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RIPK1Q13546 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RIPK1Q13546 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RIPK1Q13546 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RIPK1Q13546 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RIPK1Q13546 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RIPK1Q13546 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RIPK1Q13546 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RIPK1Q13546 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RIPK1Q13546 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RIPK1Q13546 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RIPK1Q13546 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RIPK1Q13546 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RIPK1Q13546 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RIPK1Q13546 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RIPK1Q13546 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RIPK1Q13546 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RIPK1Q13546 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RIPK1Q13546 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RIPK1Q13546 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RIPK1Q13546 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RIPK1Q13546 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RIPK1Q13546 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RIPK1Q13546 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RIPK1Q13546 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RIPK1Q13546 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RIPK1Q13546 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RIPK1Q13546 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RIPK1Q13546 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RIPK1Q13546 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RIPK1Q13546 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RIPK1Q13546 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RIPK1Q13546 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RIPK1Q13546 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RIPK1Q13546 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RIPK1Q13546 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RIPK1Q13546 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RIPK1Q13546 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RIPK1Q13546 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RIPK1Q13546 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RIPK1Q13546 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RIPK1Q13546 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RIPK1Q13546 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RIPK1Q13546 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RIPK1Q13546 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RIPK1Q13546 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RIPK1Q13546 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RIPK1Q13546 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RIPK1Q13546 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RIPK1Q13546 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RIPK1Q13546 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RIPK1Q13546 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RIPK1Q13546 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RIPK1Q13546 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RIPK1Q13546 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RIPK1Q13546 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RIPK1Q13546 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RIPK1Q13546 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RIPK1Q13546 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RIPK1Q13546 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RIPK1Q13546 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RIPK1Q13546 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RIPK1Q13546 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
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