Protein–RNA interactions for Protein: Q12200

NCR1, NPC intracellular cholesterol transporter 1-related protein 1, yeastyeast

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Length 1,170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NCR1Q12200 LAC1YKL008C 1257 nt8.66□□□□□ -1.02
NCR1Q12200 JLP1YLL057C 1239 nt8.66□□□□□ -1.02
NCR1Q12200 DUG3YNL191W 1074 nt8.66□□□□□ -1.02
NCR1Q12200 RGS2YOR107W 930 nt8.66□□□□□ -1.02
NCR1Q12200 YPL077CYPL077C 723 nt8.66□□□□□ -1.02
NCR1Q12200 HUT1YPL244C 1020 nt8.66□□□□□ -1.02
NCR1Q12200 AGP3YFL055W 1677 nt8.65□□□□□ -1.02
NCR1Q12200 TOS4YLR183C 1470 nt8.65□□□□□ -1.02
NCR1Q12200 LTV1YKL143W 1392 nt8.65□□□□□ -1.02
NCR1Q12200 TAF10YDR167W 621 nt8.65□□□□□ -1.02
NCR1Q12200 RTT105YER104W 627 nt8.65□□□□□ -1.02
NCR1Q12200 CUP1-1YHR053C 186 nt8.65□□□□□ -1.02
NCR1Q12200 CUP1-2YHR055C 186 nt8.65□□□□□ -1.02
NCR1Q12200 RPP1YHR062C 882 nt8.65□□□□□ -1.02
NCR1Q12200 AIM19YIL087C 474 nt8.65□□□□□ -1.02
NCR1Q12200 YIR035CYIR035C 765 nt8.65□□□□□ -1.02
NCR1Q12200 CMC1YKL137W 336 nt8.65□□□□□ -1.02
NCR1Q12200 YMR085WYMR085W 1299 nt8.65□□□□□ -1.02
NCR1Q12200 GET4YOR164C 939 nt8.65□□□□□ -1.02
NCR1Q12200 YPL191CYPL191C 1083 nt8.65□□□□□ -1.02
NCR1Q12200 CKS1YBR135W 453 nt8.65□□□□□ -1.02
NCR1Q12200 NFI1YOR156C 2181 nt8.65□□□□□ -1.03
NCR1Q12200 PRP46YPL151C 1356 nt8.64□□□□□ -1.03
NCR1Q12200 TOS1YBR162C 1368 nt8.64□□□□□ -1.03
NCR1Q12200 DTR1YBR180W 1719 nt8.64□□□□□ -1.03
NCR1Q12200 TLG1YDR468C 675 nt8.64□□□□□ -1.03
NCR1Q12200 GLE2YER107C 1098 nt8.64□□□□□ -1.03
NCR1Q12200 YGL230CYGL230C 444 nt8.64□□□□□ -1.03
NCR1Q12200 EMC4YGL231C 573 nt8.64□□□□□ -1.03
NCR1Q12200 YGR015CYGR015C 987 nt8.64□□□□□ -1.03
NCR1Q12200 YBL095WYBL095W 813 nt8.64□□□□□ -1.03
NCR1Q12200 OLA1YBR025C 1185 nt8.64□□□□□ -1.03
NCR1Q12200 DAP1YPL170W 459 nt8.64□□□□□ -1.03
NCR1Q12200 YPL205CYPL205C 345 nt8.64□□□□□ -1.03
NCR1Q12200 YPR160C-AYPR160C-A 285 nt8.64□□□□□ -1.03
NCR1Q12200 EUG1YDR518W 1554 nt8.64□□□□□ -1.03
NCR1Q12200 ADY4YLR227C 1482 nt8.64□□□□□ -1.03
NCR1Q12200 OST1YJL002C 1431 nt8.63□□□□□ -1.03
NCR1Q12200 TRM11YOL124C 1302 nt8.63□□□□□ -1.03
NCR1Q12200 VCX1YDL128W 1236 nt8.63□□□□□ -1.03
NCR1Q12200 ASP1YDR321W 1146 nt8.63□□□□□ -1.03
NCR1Q12200 NOP16YER002W 696 nt8.63□□□□□ -1.03
NCR1Q12200 YGL007C-AYGL007C-A 87 nt8.63□□□□□ -1.03
NCR1Q12200 ILM1YJR118C 612 nt8.63□□□□□ -1.03
NCR1Q12200 ERG27YLR100W 1044 nt8.63□□□□□ -1.03
NCR1Q12200 ATG38YLR211C 681 nt8.63□□□□□ -1.03
NCR1Q12200 YNL205CYNL205C 423 nt8.63□□□□□ -1.03
NCR1Q12200 VPS30YPL120W 1674 nt8.62□□□□□ -1.03
NCR1Q12200 WBP1YEL002C 1293 nt8.62□□□□□ -1.03
NCR1Q12200 TYS1YGR185C 1185 nt8.62□□□□□ -1.03
NCR1Q12200 YJU2YKL095W 837 nt8.62□□□□□ -1.03
NCR1Q12200 NNT1YLR285W 786 nt8.62□□□□□ -1.03
NCR1Q12200 FMP41YNL168C 780 nt8.62□□□□□ -1.03
NCR1Q12200 YOR342CYOR342C 960 nt8.62□□□□□ -1.03
NCR1Q12200 RHO1YPR165W 630 nt8.62□□□□□ -1.03
NCR1Q12200 GAL2YLR081W 1725 nt8.62□□□□□ -1.03
NCR1Q12200 MFG1YDL233W 1377 nt8.61□□□□□ -1.03
NCR1Q12200 DXO1YDR370C 1329 nt8.61□□□□□ -1.03
NCR1Q12200 HOG1YLR113W 1308 nt8.61□□□□□ -1.03
NCR1Q12200 RIT1YMR283C 1542 nt8.61□□□□□ -1.03
NCR1Q12200 MGT1YDL200C 567 nt8.61□□□□□ -1.03
NCR1Q12200 YDR445CYDR445C 408 nt8.61□□□□□ -1.03
NCR1Q12200 CHO1YER026C 831 nt8.61□□□□□ -1.03
NCR1Q12200 APQ13YJL075C 417 nt8.61□□□□□ -1.03
NCR1Q12200 YBL036CYBL036C 774 nt8.61□□□□□ -1.03
NCR1Q12200 CYT1YOR065W 930 nt8.61□□□□□ -1.03
NCR1Q12200 RPB8YOR224C 441 nt8.61□□□□□ -1.03
NCR1Q12200 PNT1YOR266W 1272 nt8.61□□□□□ -1.03
NCR1Q12200 YPL038W-AYPL038W-A 192 nt8.61□□□□□ -1.03
NCR1Q12200 SAL1YNL083W 1485 nt8.61□□□□□ -1.03
NCR1Q12200 AGE1YDR524C 1449 nt8.61□□□□□ -1.03
NCR1Q12200 YEF1YEL041W 1488 nt8.6□□□□□ -1.03
NCR1Q12200 CWC23YGL128C 852 nt8.6□□□□□ -1.03
NCR1Q12200 YNK1YKL067W 462 nt8.6□□□□□ -1.03
NCR1Q12200 YLL017WYLL017W 312 nt8.6□□□□□ -1.03
NCR1Q12200 RRN10YBL025W 438 nt8.6□□□□□ -1.03
NCR1Q12200 BUB2YMR055C 921 nt8.6□□□□□ -1.03
NCR1Q12200 PRS4YBL068W 981 nt8.6□□□□□ -1.03
NCR1Q12200 WRS1YOL097C 1299 nt8.6□□□□□ -1.03
NCR1Q12200 SDC1YDR469W 528 nt8.59□□□□□ -1.03
NCR1Q12200 YFL012W-AYFL012W-A 375 nt8.59□□□□□ -1.03
NCR1Q12200 YJL043WYJL043W 774 nt8.59□□□□□ -1.03
NCR1Q12200 GPN3YLR243W 819 nt8.59□□□□□ -1.03
NCR1Q12200 OXR1YPL196W 822 nt8.59□□□□□ -1.03
NCR1Q12200 POL30YBR088C 777 nt8.59□□□□□ -1.03
NCR1Q12200 NUP53YMR153W 1428 nt8.59□□□□□ -1.03
NCR1Q12200 YLR072WYLR072W 2082 nt8.58□□□□□ -1.04
NCR1Q12200 MEP1YGR121C 1479 nt8.58□□□□□ -1.04
NCR1Q12200 ABD1YBR236C 1311 nt8.58□□□□□ -1.04
NCR1Q12200 IMG2YCR071C 441 nt8.58□□□□□ -1.04
NCR1Q12200 DOG2YHR043C 741 nt8.58□□□□□ -1.04
NCR1Q12200 DOG1YHR044C 741 nt8.58□□□□□ -1.04
NCR1Q12200 PEX18YHR160C 852 nt8.58□□□□□ -1.04
NCR1Q12200 MRS4YKR052C 915 nt8.58□□□□□ -1.04
NCR1Q12200 SFH1YLR321C 1281 nt8.58□□□□□ -1.04
NCR1Q12200 FUS3YBL016W 1062 nt8.58□□□□□ -1.04
NCR1Q12200 YMR206WYMR206W 942 nt8.58□□□□□ -1.04
NCR1Q12200 YNL324WYNL324W 396 nt8.58□□□□□ -1.04
NCR1Q12200 YOL013W-BYOL013W-B 291 nt8.58□□□□□ -1.04
NCR1Q12200 YPR172WYPR172W 603 nt8.58□□□□□ -1.04
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