Protein–RNA interactions for Protein: Q06148

NEJ1, Non-homologous end-joining protein 1, yeastyeast

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NEJ1Q06148 HXT5YHR096C 1779 nt4.95□□□□□ -1.62
NEJ1Q06148 QRI1YDL103C 1434 nt4.95□□□□□ -1.62
NEJ1Q06148 CTS1YLR286C 1689 nt4.95□□□□□ -1.62
NEJ1Q06148 IMA1YGR287C 1770 nt4.94□□□□□ -1.62
NEJ1Q06148 MRK1YDL079C 1506 nt4.94□□□□□ -1.62
NEJ1Q06148 AAD4YDL243C 990 nt4.94□□□□□ -1.62
NEJ1Q06148 YNL019CYNL019C 855 nt4.94□□□□□ -1.62
NEJ1Q06148 YNL033WYNL033W 855 nt4.94□□□□□ -1.62
NEJ1Q06148 NSI1YDR026C 1713 nt4.94□□□□□ -1.62
NEJ1Q06148 CUE2YKL090W 1332 nt4.94□□□□□ -1.62
NEJ1Q06148 ELP2YGR200C 2367 nt4.93□□□□□ -1.62
NEJ1Q06148 SOG2YOR353C 2376 nt4.93□□□□□ -1.62
NEJ1Q06148 DFG5YMR238W 1377 nt4.93□□□□□ -1.62
NEJ1Q06148 NCS6YGL211W 1080 nt4.93□□□□□ -1.62
NEJ1Q06148 GTO1YGR154C 1071 nt4.93□□□□□ -1.62
NEJ1Q06148 IMD1YAR073W 1212 nt4.93□□□□□ -1.62
NEJ1Q06148 ECM33YBR078W 1290 nt4.93□□□□□ -1.62
NEJ1Q06148 SED4YCR067C 3198 nt4.93□□□□□ -1.62
NEJ1Q06148 RPT1YKL145W 1404 nt4.92□□□□□ -1.62
NEJ1Q06148 YGL185CYGL185C 1140 nt4.92□□□□□ -1.62
NEJ1Q06148 PPG1YNR032W 1107 nt4.92□□□□□ -1.62
NEJ1Q06148 snR10snR10 245 nt4.92□□□□□ -1.62
NEJ1Q06148 YPL062WYPL062W 405 nt4.92□□□□□ -1.62
NEJ1Q06148 SHM1YBR263W 1473 nt4.92□□□□□ -1.62
NEJ1Q06148 MET7YOR241W 1647 nt4.91□□□□□ -1.62
NEJ1Q06148 YER187WYER187W 426 nt4.91□□□□□ -1.62
NEJ1Q06148 PAN6YIL145C 930 nt4.91□□□□□ -1.62
NEJ1Q06148 YJR085CYJR085C 318 nt4.91□□□□□ -1.62
NEJ1Q06148 CKA2YOR061W 1020 nt4.91□□□□□ -1.62
NEJ1Q06148 TUL1YKL034W 2277 nt4.91□□□□□ -1.62
NEJ1Q06148 DAL81YIR023W 2913 nt4.9□□□□□ -1.62
NEJ1Q06148 UGA1YGR019W 1416 nt4.9□□□□□ -1.62
NEJ1Q06148 MNS1YJR131W 1650 nt4.9□□□□□ -1.62
NEJ1Q06148 UBA2YDR390C 1911 nt4.9□□□□□ -1.62
NEJ1Q06148 GRX4YER174C 735 nt4.9□□□□□ -1.63
NEJ1Q06148 DBP8YHR169W 1296 nt4.9□□□□□ -1.63
NEJ1Q06148 STE7YDL159W 1548 nt4.9□□□□□ -1.63
NEJ1Q06148 PAL1YDR348C 1500 nt4.9□□□□□ -1.63
NEJ1Q06148 BNA5YLR231C 1362 nt4.9□□□□□ -1.63
NEJ1Q06148 ULA1YPL003W 1389 nt4.9□□□□□ -1.63
NEJ1Q06148 NGR1YBR212W 2019 nt4.89□□□□□ -1.63
NEJ1Q06148 MMP1YLL061W 1752 nt4.89□□□□□ -1.63
NEJ1Q06148 YCR047W-AYCR047W-A 207 nt4.89□□□□□ -1.63
NEJ1Q06148 YIR020W-AYIR020W-A 243 nt4.89□□□□□ -1.63
NEJ1Q06148 PIN2YOR104W 849 nt4.89□□□□□ -1.63
NEJ1Q06148 OPT1YJL212C 2400 nt4.89□□□□□ -1.63
NEJ1Q06148 ARB1YER036C 1833 nt4.88□□□□□ -1.63
NEJ1Q06148 MHF2YDL160C-A 243 nt4.88□□□□□ -1.63
NEJ1Q06148 MOG1YJR074W 657 nt4.88□□□□□ -1.63
NEJ1Q06148 PSE1YMR308C 3270 nt4.88□□□□□ -1.63
NEJ1Q06148 SEC39YLR440C 2130 nt4.88□□□□□ -1.63
NEJ1Q06148 UBP9YER098W 2265 nt4.88□□□□□ -1.63
NEJ1Q06148 PMT2YAL023C 2280 nt4.88□□□□□ -1.63
NEJ1Q06148 PRP45YAL032C 1140 nt4.87□□□□□ -1.63
NEJ1Q06148 VMA13YPR036W 1437 nt4.87□□□□□ -1.63
NEJ1Q06148 TFC6YDR362C 2019 nt4.87□□□□□ -1.63
NEJ1Q06148 CDC4YFL009W 2340 nt4.86□□□□□ -1.63
NEJ1Q06148 YHR045WYHR045W 1683 nt4.86□□□□□ -1.63
NEJ1Q06148 ARN2YHL047C 1863 nt4.86□□□□□ -1.63
NEJ1Q06148 YDR154CYDR154C 351 nt4.86□□□□□ -1.63
NEJ1Q06148 RPL28YGL103W 450 nt4.86□□□□□ -1.63
NEJ1Q06148 MED6YHR058C 888 nt4.86□□□□□ -1.63
NEJ1Q06148 SFK1YKL051W 1062 nt4.86□□□□□ -1.63
NEJ1Q06148 ZRT2YLR130C 1269 nt4.86□□□□□ -1.63
NEJ1Q06148 DRS1YLL008W 2259 nt4.86□□□□□ -1.63
NEJ1Q06148 TUP1YCR084C 2142 nt4.85□□□□□ -1.63
NEJ1Q06148 DFM1YDR411C 1026 nt4.85□□□□□ -1.63
NEJ1Q06148 ERD1YDR414C 1089 nt4.85□□□□□ -1.63
NEJ1Q06148 ROX3YBL093C 663 nt4.85□□□□□ -1.63
NEJ1Q06148 DEF1YKL054C 2217 nt4.84□□□□□ -1.63
NEJ1Q06148 ATG20YDL113C 1923 nt4.84□□□□□ -1.63
NEJ1Q06148 tN(GUU)CtN(GUU)C 74 nt4.84□□□□□ -1.63
NEJ1Q06148 tN(GUU)FtN(GUU)F 74 nt4.84□□□□□ -1.63
NEJ1Q06148 tN(GUU)GtN(GUU)G 74 nt4.84□□□□□ -1.63
NEJ1Q06148 tN(GUU)KtN(GUU)K 74 nt4.84□□□□□ -1.63
NEJ1Q06148 tN(GUU)LtN(GUU)L 74 nt4.84□□□□□ -1.63
NEJ1Q06148 tN(GUU)N1tN(GUU)N1 74 nt4.84□□□□□ -1.63
NEJ1Q06148 tN(GUU)N2tN(GUU)N2 74 nt4.84□□□□□ -1.63
NEJ1Q06148 tN(GUU)O1tN(GUU)O1 74 nt4.84□□□□□ -1.63
NEJ1Q06148 tN(GUU)O2tN(GUU)O2 74 nt4.84□□□□□ -1.63
NEJ1Q06148 tN(GUU)PtN(GUU)P 74 nt4.84□□□□□ -1.63
NEJ1Q06148 PUF3YLL013C 2640 nt4.84□□□□□ -1.63
NEJ1Q06148 HXT14YNL318C 1623 nt4.83□□□□□ -1.64
NEJ1Q06148 ADE13YLR359W 1449 nt4.83□□□□□ -1.64
NEJ1Q06148 SUA5YGL169W 1281 nt4.83□□□□□ -1.64
NEJ1Q06148 PRE3YJL001W 648 nt4.83□□□□□ -1.64
NEJ1Q06148 YLL059CYLL059C 507 nt4.83□□□□□ -1.64
NEJ1Q06148 ENV7YPL236C 1095 nt4.83□□□□□ -1.64
NEJ1Q06148 AFT1YGL071W 2073 nt4.82□□□□□ -1.64
NEJ1Q06148 WTM2YOR229W 1404 nt4.82□□□□□ -1.64
NEJ1Q06148 STE20YHL007C 2820 nt4.82□□□□□ -1.64
NEJ1Q06148 COX26YDR119W-A 201 nt4.82□□□□□ -1.64
NEJ1Q06148 SCW4YGR279C 1161 nt4.82□□□□□ -1.64
NEJ1Q06148 SOL1YNR034W 966 nt4.82□□□□□ -1.64
NEJ1Q06148 YPL041CYPL041C 624 nt4.82□□□□□ -1.64
NEJ1Q06148 PHO90YJL198W 2646 nt4.82□□□□□ -1.64
NEJ1Q06148 YIL067CYIL067C 2037 nt4.82□□□□□ -1.64
NEJ1Q06148 SNF3YDL194W 2655 nt4.81□□□□□ -1.64
NEJ1Q06148 NUD1YOR373W 2556 nt4.81□□□□□ -1.64
NEJ1Q06148 SIT4YDL047W 936 nt4.81□□□□□ -1.64
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 17.2 ms