Protein–RNA interactions for Protein: Q02199

NUP49, Nucleoporin NUP49/NSP49, yeastyeast

Predictions only

Length 472 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NUP49Q02199 PDI1YCL043C 1569 nt4.95□□□□□ -1.62
NUP49Q02199 XPT1YJR133W 630 nt4.95□□□□□ -1.62
NUP49Q02199 SNO4YMR322C 714 nt4.95□□□□□ -1.62
NUP49Q02199 PDR16YNL231C 1056 nt4.95□□□□□ -1.62
NUP49Q02199 snR10snR10 245 nt4.95□□□□□ -1.62
NUP49Q02199 HSP33YOR391C 714 nt4.95□□□□□ -1.62
NUP49Q02199 YPL102CYPL102C 303 nt4.95□□□□□ -1.62
NUP49Q02199 HSP32YPL280W 714 nt4.95□□□□□ -1.62
NUP49Q02199 MET8YBR213W 825 nt4.95□□□□□ -1.62
NUP49Q02199 QRI1YDL103C 1434 nt4.95□□□□□ -1.62
NUP49Q02199 RPT1YKL145W 1404 nt4.95□□□□□ -1.62
NUP49Q02199 ARO10YDR380W 1908 nt4.95□□□□□ -1.62
NUP49Q02199 SHM1YBR263W 1473 nt4.94□□□□□ -1.62
NUP49Q02199 KIP2YPL155C 2121 nt4.94□□□□□ -1.62
NUP49Q02199 OCA5YHL029C 2040 nt4.94□□□□□ -1.62
NUP49Q02199 GLT1YDL171C 6438 nt4.94□□□□□ -1.62
NUP49Q02199 CTS1YLR286C 1689 nt4.94□□□□□ -1.62
NUP49Q02199 YER187WYER187W 426 nt4.94□□□□□ -1.62
NUP49Q02199 YFR052C-AYFR052C-A 306 nt4.94□□□□□ -1.62
NUP49Q02199 CTR2YHR175W 570 nt4.94□□□□□ -1.62
NUP49Q02199 SHP1YBL058W 1272 nt4.94□□□□□ -1.62
NUP49Q02199 RPS19BYNL302C 435 nt4.94□□□□□ -1.62
NUP49Q02199 MCH4YOL119C 1506 nt4.93□□□□□ -1.62
NUP49Q02199 YDR154CYDR154C 351 nt4.93□□□□□ -1.62
NUP49Q02199 GPM3YOL056W 912 nt4.93□□□□□ -1.62
NUP49Q02199 SCO1YBR037C 888 nt4.93□□□□□ -1.62
NUP49Q02199 YPL041CYPL041C 624 nt4.93□□□□□ -1.62
NUP49Q02199 CUE2YKL090W 1332 nt4.93□□□□□ -1.62
NUP49Q02199 DCI1YOR180C 816 nt4.92□□□□□ -1.62
NUP49Q02199 PUS1YPL212C 1635 nt4.92□□□□□ -1.62
NUP49Q02199 YDL144CYDL144C 1071 nt4.91□□□□□ -1.62
NUP49Q02199 CTR3YLR411W 726 nt4.91□□□□□ -1.62
NUP49Q02199 MDY2YOL111C 639 nt4.91□□□□□ -1.62
NUP49Q02199 ISU2YOR226C 471 nt4.91□□□□□ -1.62
NUP49Q02199 ACS2YLR153C 2052 nt4.91□□□□□ -1.62
NUP49Q02199 YNL095CYNL095C 1929 nt4.91□□□□□ -1.62
NUP49Q02199 SPC97YHR172W 2472 nt4.9□□□□□ -1.62
NUP49Q02199 YHR045WYHR045W 1683 nt4.9□□□□□ -1.62
NUP49Q02199 BUD14YAR014C 2130 nt4.9□□□□□ -1.62
NUP49Q02199 PWP1YLR196W 1731 nt4.9□□□□□ -1.62
NUP49Q02199 tN(GUU)CtN(GUU)C 74 nt4.9□□□□□ -1.63
NUP49Q02199 tN(GUU)FtN(GUU)F 74 nt4.9□□□□□ -1.63
NUP49Q02199 tN(GUU)GtN(GUU)G 74 nt4.9□□□□□ -1.63
NUP49Q02199 tN(GUU)KtN(GUU)K 74 nt4.9□□□□□ -1.63
NUP49Q02199 tN(GUU)LtN(GUU)L 74 nt4.9□□□□□ -1.63
NUP49Q02199 tN(GUU)N1tN(GUU)N1 74 nt4.9□□□□□ -1.63
NUP49Q02199 tN(GUU)N2tN(GUU)N2 74 nt4.9□□□□□ -1.63
NUP49Q02199 tN(GUU)O1tN(GUU)O1 74 nt4.9□□□□□ -1.63
NUP49Q02199 tN(GUU)O2tN(GUU)O2 74 nt4.9□□□□□ -1.63
NUP49Q02199 tN(GUU)PtN(GUU)P 74 nt4.9□□□□□ -1.63
NUP49Q02199 RPR2YIR015W 435 nt4.9□□□□□ -1.63
NUP49Q02199 SEN34YAR008W 828 nt4.9□□□□□ -1.63
NUP49Q02199 BUB3YOR026W 1026 nt4.9□□□□□ -1.63
NUP49Q02199 CAM1YPL048W 1248 nt4.9□□□□□ -1.63
NUP49Q02199 RAD53YPL153C 2466 nt4.9□□□□□ -1.63
NUP49Q02199 APM2YHL019C 1818 nt4.9□□□□□ -1.63
NUP49Q02199 VPS72YDR485C 2388 nt4.9□□□□□ -1.63
NUP49Q02199 PDE1YGL248W 1110 nt4.89□□□□□ -1.63
NUP49Q02199 GTO1YGR154C 1071 nt4.89□□□□□ -1.63
NUP49Q02199 YKL107WYKL107W 930 nt4.89□□□□□ -1.63
NUP49Q02199 LST8YNL006W 912 nt4.89□□□□□ -1.63
NUP49Q02199 YOR1YGR281W 4434 nt4.89□□□□□ -1.63
NUP49Q02199 DFG5YMR238W 1377 nt4.89□□□□□ -1.63
NUP49Q02199 UGA1YGR019W 1416 nt4.89□□□□□ -1.63
NUP49Q02199 VMA13YPR036W 1437 nt4.89□□□□□ -1.63
NUP49Q02199 MKC7YDR144C 1791 nt4.88□□□□□ -1.63
NUP49Q02199 EXO1YOR033C 2109 nt4.88□□□□□ -1.63
NUP49Q02199 PAL1YDR348C 1500 nt4.88□□□□□ -1.63
NUP49Q02199 TUL1YKL034W 2277 nt4.88□□□□□ -1.63
NUP49Q02199 SUA5YGL169W 1281 nt4.88□□□□□ -1.63
NUP49Q02199 PIN2YOR104W 849 nt4.88□□□□□ -1.63
NUP49Q02199 ULA1YPL003W 1389 nt4.88□□□□□ -1.63
NUP49Q02199 MGS1YNL218W 1764 nt4.88□□□□□ -1.63
NUP49Q02199 UBP9YER098W 2265 nt4.88□□□□□ -1.63
NUP49Q02199 ATG20YDL113C 1923 nt4.87□□□□□ -1.63
NUP49Q02199 MCX1YBR227C 1563 nt4.87□□□□□ -1.63
NUP49Q02199 CYK3YDL117W 2658 nt4.87□□□□□ -1.63
NUP49Q02199 ARB1YER036C 1833 nt4.87□□□□□ -1.63
NUP49Q02199 NUD1YOR373W 2556 nt4.87□□□□□ -1.63
NUP49Q02199 SED4YCR067C 3198 nt4.86□□□□□ -1.63
NUP49Q02199 HXT5YHR096C 1779 nt4.86□□□□□ -1.63
NUP49Q02199 MMP1YLL061W 1752 nt4.86□□□□□ -1.63
NUP49Q02199 PHM8YER037W 966 nt4.86□□□□□ -1.63
NUP49Q02199 ROX3YBL093C 663 nt4.86□□□□□ -1.63
NUP49Q02199 ARR3YPR201W 1215 nt4.86□□□□□ -1.63
NUP49Q02199 PEX32YBR168W 1242 nt4.86□□□□□ -1.63
NUP49Q02199 PHO90YJL198W 2646 nt4.86□□□□□ -1.63
NUP49Q02199 DAL81YIR023W 2913 nt4.85□□□□□ -1.63
NUP49Q02199 AAD4YDL243C 990 nt4.85□□□□□ -1.63
NUP49Q02199 PPG1YNR032W 1107 nt4.85□□□□□ -1.63
NUP49Q02199 STE7YDL159W 1548 nt4.85□□□□□ -1.63
NUP49Q02199 NGR1YBR212W 2019 nt4.84□□□□□ -1.63
NUP49Q02199 COX26YDR119W-A 201 nt4.84□□□□□ -1.63
NUP49Q02199 RPL28YGL103W 450 nt4.84□□□□□ -1.63
NUP49Q02199 YGR022CYGR022C 330 nt4.84□□□□□ -1.63
NUP49Q02199 YNL019CYNL019C 855 nt4.84□□□□□ -1.63
NUP49Q02199 YNL033WYNL033W 855 nt4.84□□□□□ -1.63
NUP49Q02199 NGL2YMR285C 1548 nt4.83□□□□□ -1.64
NUP49Q02199 YDL034WYDL034W 345 nt4.83□□□□□ -1.64
NUP49Q02199 URA3YEL021W 804 nt4.83□□□□□ -1.64
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