Protein–RNA interactions for Protein: P82663

MRPS25, 28S ribosomal protein S25, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 173 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPS25P82663 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MRPS25P82663 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MRPS25P82663 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MRPS25P82663 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MRPS25P82663 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MRPS25P82663 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MRPS25P82663 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MRPS25P82663 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MRPS25P82663 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MRPS25P82663 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MRPS25P82663 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MRPS25P82663 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MRPS25P82663 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MRPS25P82663 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MRPS25P82663 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MRPS25P82663 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MRPS25P82663 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MRPS25P82663 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MRPS25P82663 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MRPS25P82663 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MRPS25P82663 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MRPS25P82663 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MRPS25P82663 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MRPS25P82663 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MRPS25P82663 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MRPS25P82663 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MRPS25P82663 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MRPS25P82663 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
MRPS25P82663 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
MRPS25P82663 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MRPS25P82663 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MRPS25P82663 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
MRPS25P82663 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
MRPS25P82663 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
MRPS25P82663 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
MRPS25P82663 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MRPS25P82663 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MRPS25P82663 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MRPS25P82663 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MRPS25P82663 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MRPS25P82663 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MRPS25P82663 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MRPS25P82663 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
MRPS25P82663 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
MRPS25P82663 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MRPS25P82663 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MRPS25P82663 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MRPS25P82663 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MRPS25P82663 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MRPS25P82663 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MRPS25P82663 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MRPS25P82663 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MRPS25P82663 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MRPS25P82663 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MRPS25P82663 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MRPS25P82663 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MRPS25P82663 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MRPS25P82663 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MRPS25P82663 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MRPS25P82663 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MRPS25P82663 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MRPS25P82663 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MRPS25P82663 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MRPS25P82663 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MRPS25P82663 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MRPS25P82663 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MRPS25P82663 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MRPS25P82663 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MRPS25P82663 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MRPS25P82663 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MRPS25P82663 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MRPS25P82663 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MRPS25P82663 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MRPS25P82663 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MRPS25P82663 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MRPS25P82663 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MRPS25P82663 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MRPS25P82663 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MRPS25P82663 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MRPS25P82663 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MRPS25P82663 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MRPS25P82663 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MRPS25P82663 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MRPS25P82663 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MRPS25P82663 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MRPS25P82663 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MRPS25P82663 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MRPS25P82663 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MRPS25P82663 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MRPS25P82663 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MRPS25P82663 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MRPS25P82663 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MRPS25P82663 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MRPS25P82663 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MRPS25P82663 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MRPS25P82663 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MRPS25P82663 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MRPS25P82663 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MRPS25P82663 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MRPS25P82663 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms