Protein–RNA interactions for Protein: P61163

ACTR1A, Alpha-centractin, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTR1AP61163 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ACTR1AP61163 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ACTR1AP61163 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ACTR1AP61163 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ACTR1AP61163 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ACTR1AP61163 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
ACTR1AP61163 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ACTR1AP61163 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ACTR1AP61163 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ACTR1AP61163 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ACTR1AP61163 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ACTR1AP61163 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
ACTR1AP61163 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ACTR1AP61163 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ACTR1AP61163 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ACTR1AP61163 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ACTR1AP61163 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ACTR1AP61163 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ACTR1AP61163 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ACTR1AP61163 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ACTR1AP61163 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ACTR1AP61163 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ACTR1AP61163 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ACTR1AP61163 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ACTR1AP61163 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ACTR1AP61163 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
ACTR1AP61163 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ACTR1AP61163 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ACTR1AP61163 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ACTR1AP61163 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ACTR1AP61163 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ACTR1AP61163 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ACTR1AP61163 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ACTR1AP61163 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ACTR1AP61163 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ACTR1AP61163 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ACTR1AP61163 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ACTR1AP61163 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ACTR1AP61163 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ACTR1AP61163 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
ACTR1AP61163 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ACTR1AP61163 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ACTR1AP61163 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ACTR1AP61163 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ACTR1AP61163 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ACTR1AP61163 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ACTR1AP61163 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ACTR1AP61163 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ACTR1AP61163 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ACTR1AP61163 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ACTR1AP61163 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ACTR1AP61163 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ACTR1AP61163 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ACTR1AP61163 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ACTR1AP61163 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ACTR1AP61163 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ACTR1AP61163 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ACTR1AP61163 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ACTR1AP61163 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ACTR1AP61163 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ACTR1AP61163 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ACTR1AP61163 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ACTR1AP61163 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ACTR1AP61163 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ACTR1AP61163 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ACTR1AP61163 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ACTR1AP61163 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ACTR1AP61163 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
ACTR1AP61163 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ACTR1AP61163 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ACTR1AP61163 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ACTR1AP61163 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ACTR1AP61163 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ACTR1AP61163 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ACTR1AP61163 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ACTR1AP61163 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ACTR1AP61163 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ACTR1AP61163 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ACTR1AP61163 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
ACTR1AP61163 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ACTR1AP61163 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ACTR1AP61163 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ACTR1AP61163 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ACTR1AP61163 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ACTR1AP61163 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ACTR1AP61163 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ACTR1AP61163 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ACTR1AP61163 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ACTR1AP61163 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ACTR1AP61163 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ACTR1AP61163 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ACTR1AP61163 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
ACTR1AP61163 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
ACTR1AP61163 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
ACTR1AP61163 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
ACTR1AP61163 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ACTR1AP61163 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ACTR1AP61163 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ACTR1AP61163 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ACTR1AP61163 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.1 ms