Protein–RNA interactions for Protein: P48728

AMT, Aminomethyltransferase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMTP48728 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
AMTP48728 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
AMTP48728 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
AMTP48728 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
AMTP48728 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
AMTP48728 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
AMTP48728 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
AMTP48728 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
AMTP48728 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
AMTP48728 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
AMTP48728 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
AMTP48728 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
AMTP48728 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
AMTP48728 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
AMTP48728 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
AMTP48728 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
AMTP48728 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
AMTP48728 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
AMTP48728 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
AMTP48728 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
AMTP48728 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
AMTP48728 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
AMTP48728 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
AMTP48728 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
AMTP48728 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
AMTP48728 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
AMTP48728 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
AMTP48728 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
AMTP48728 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
AMTP48728 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
AMTP48728 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
AMTP48728 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
AMTP48728 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
AMTP48728 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
AMTP48728 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
AMTP48728 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
AMTP48728 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
AMTP48728 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
AMTP48728 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
AMTP48728 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
AMTP48728 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
AMTP48728 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
AMTP48728 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
AMTP48728 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
AMTP48728 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
AMTP48728 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
AMTP48728 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
AMTP48728 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
AMTP48728 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
AMTP48728 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
AMTP48728 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
AMTP48728 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
AMTP48728 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
AMTP48728 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
AMTP48728 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
AMTP48728 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
AMTP48728 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
AMTP48728 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
AMTP48728 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
AMTP48728 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
AMTP48728 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
AMTP48728 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
AMTP48728 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
AMTP48728 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
AMTP48728 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
AMTP48728 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
AMTP48728 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
AMTP48728 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
AMTP48728 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
AMTP48728 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
AMTP48728 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
AMTP48728 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
AMTP48728 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
AMTP48728 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
AMTP48728 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
AMTP48728 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
AMTP48728 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
AMTP48728 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
AMTP48728 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
AMTP48728 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
AMTP48728 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
AMTP48728 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
AMTP48728 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
AMTP48728 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
AMTP48728 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
AMTP48728 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
AMTP48728 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
AMTP48728 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
AMTP48728 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
AMTP48728 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
AMTP48728 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
AMTP48728 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
AMTP48728 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
AMTP48728 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
AMTP48728 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
AMTP48728 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
AMTP48728 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
AMTP48728 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
AMTP48728 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
AMTP48728 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.3 ms