Protein–RNA interactions for Protein: P47928

ID4, DNA-binding protein inhibitor ID-4, humanhuman

Predictions only

Length 161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ID4P47928 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ID4P47928 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ID4P47928 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ID4P47928 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ID4P47928 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ID4P47928 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ID4P47928 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ID4P47928 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ID4P47928 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ID4P47928 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ID4P47928 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ID4P47928 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ID4P47928 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ID4P47928 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ID4P47928 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ID4P47928 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ID4P47928 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ID4P47928 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ID4P47928 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ID4P47928 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
ID4P47928 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ID4P47928 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ID4P47928 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
ID4P47928 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ID4P47928 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ID4P47928 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
ID4P47928 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ID4P47928 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ID4P47928 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ID4P47928 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ID4P47928 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ID4P47928 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ID4P47928 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ID4P47928 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ID4P47928 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
ID4P47928 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ID4P47928 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ID4P47928 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ID4P47928 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ID4P47928 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ID4P47928 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ID4P47928 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ID4P47928 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ID4P47928 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ID4P47928 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ID4P47928 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ID4P47928 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ID4P47928 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ID4P47928 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ID4P47928 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ID4P47928 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ID4P47928 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ID4P47928 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ID4P47928 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ID4P47928 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ID4P47928 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ID4P47928 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ID4P47928 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
ID4P47928 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ID4P47928 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ID4P47928 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ID4P47928 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ID4P47928 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ID4P47928 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ID4P47928 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ID4P47928 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ID4P47928 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ID4P47928 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ID4P47928 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ID4P47928 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ID4P47928 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ID4P47928 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ID4P47928 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ID4P47928 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
ID4P47928 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ID4P47928 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ID4P47928 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
ID4P47928 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ID4P47928 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ID4P47928 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ID4P47928 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ID4P47928 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ID4P47928 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ID4P47928 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ID4P47928 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
ID4P47928 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ID4P47928 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
ID4P47928 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ID4P47928 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ID4P47928 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ID4P47928 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ID4P47928 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ID4P47928 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ID4P47928 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
ID4P47928 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
ID4P47928 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ID4P47928 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ID4P47928 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ID4P47928 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ID4P47928 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.9 ms